Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8A1Q9Y2Q0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms