Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC4BQ9NT99 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC4BQ9NT99 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms