Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRA6Q9BX79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRA6Q9BX79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRA6Q9BX79 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms