Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms