Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR53Q7Z5U6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms