Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHLDB3Q6NSJ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHLDB3Q6NSJ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms