Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ODF4Q2M2E3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms