Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKN3Q16667 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKN3Q16667 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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