Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF1CQ15572 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF1CQ15572 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF1CQ15572 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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