Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTAN1Q13813 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTAN1Q13813 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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