Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN1P53805 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCAN1P53805 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms