Protein–RNA interactions for Protein: P33301

XRS2, DNA repair protein XRS2, yeast

Predictions only

Length 854 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	P33301	YGR026W	YGR026W	837 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YGR111W	YGR111W	1203 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	RTA1	YGR213C	954 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	BIO2	YGR286C	1128 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	CDC12	YHR107C	1224 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	GTT1	YIR038C	705 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	SIL1	YOL031C	1266 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	HAT1	YPL001W	1125 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YBR242W	YBR242W	717 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	POF1	YCL047C	777 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	NHX1	YDR456W	1902 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YBR238C	YBR238C	2196 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.24	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	BSC2	YDR275W	708 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YDR535C	YDR535C	501 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	PSF2	YJL072C	642 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YAL066W	YAL066W	309 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YAR075W	YAR075W	474 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YPT53	YNL093W	663 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	TRM112	YNR046W	408 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	SUR1	YPL057C	1149 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	ARO4	YBR249C	1113 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	ECM18	YDR125C	1362 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	HSE1	YHL002W	1359 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	ARO80	YDR421W	2853 nt		4.23	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	VMA1	YDL185W	3216 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YGL218W	YGL218W	651 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	EPO1	YMR124W	2832 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	NTA1	YJR062C	1374 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	PIM1	YBL022C	3402 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	SEC59	YMR013C	1560 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	MSS4	YDR208W	2340 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.22	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	VPS45	YGL095C	1734 nt		4.21	□□□□□ -1.73
XRS2	P33301	TSC13	YDL015C	933 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	HSP42	YDR171W	1128 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	AHA1	YDR214W	1053 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YFL051C	YFL051C	483 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	CAP2	YIL034C	864 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SMD3	YLR147C	306 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	RET3	YPL010W	570 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	CIT1	YNR001C	1440 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YPR148C	YPR148C	1308 nt		4.21	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SST2	YLR452C	2097 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	MTC4	YBR255W	2085 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YPL109C	YPL109C	1974 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	CTM1	YHR109W	1758 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	ORC4	YPR162C	1590 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	IRC22	YEL001C	678 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YGL138C	YGL138C	1038 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	MET14	YKL001C	609 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	GPN3	YLR243W	819 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SSO2	YMR183C	888 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YOR097C	YOR097C	528 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SLM4	YBR077C	489 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	GAC1	YOR178C	2382 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	GEM1	YAL048C	1989 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	ROD1	YOR018W	2514 nt		4.2	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YJR096W	YJR096W	849 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YMR099C	YMR099C	894 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	TYE7	YOR344C	876 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	FRM2	YCL026C-A	582 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	ISW2	YOR304W	3363 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	ULP1	YPL020C	1866 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	VHS3	YOR054C	2025 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YDR131C	YDR131C	1671 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SAD1	YFR005C	1347 nt		4.19	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	CUE3	YGL110C	1875 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	GYP6	YJL044C	1377 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YIG1	YPL201C	1386 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YDR230W	YDR230W	348 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	GCD14	YJL125C	1152 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	RFA3	YJL173C	369 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SUI2	YJR007W	915 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	PAM18	YLR008C	507 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SAM37	YMR060C	984 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	CWH43	YCR017C	2862 nt		4.18	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	RRP17	YDR412W	708 nt		4.17	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YOR082C	YOR082C	342 nt		4.17	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	THI80	YOR143C	960 nt		4.17	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	ERV15	YBR210W	429 nt		4.17	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YGR117C	YGR117C	1431 nt		4.17	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	VID28	YIL017C	2766 nt		4.17	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	UTP25	YIL091C	2166 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	CWC2	YDL209C	1020 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YGL117W	YGL117W	798 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YGL204C	YGL204C	306 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YKR070W	YKR070W	1059 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SPC2	YML055W	537 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	FMP41	YNL168C	780 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	SFG1	YOR315W	1041 nt		4.16	□□□□□ -1.74
XRS2	P33301	YPR078C	YPR078C	1119 nt		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 109.3 ms