Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1P21675 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1P21675 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TAF1P21675 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF1P21675 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF1P21675 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF1P21675 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF1P21675 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TAF1P21675 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TAF1P21675 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TAF1P21675 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF1P21675 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1P21675 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1P21675 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1P21675 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1P21675 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms