Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTNP21246 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTNP21246 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTNP21246 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTNP21246 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTNP21246 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTNP21246 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTNP21246 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTNP21246 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms