Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF40AO75400 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms