Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROB1E7EW31 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROB1E7EW31 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms