Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBF4Q9BQW3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms