Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC82Q8N4S0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms