Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCUBE3Q8IX30 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCUBE3Q8IX30 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms