Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PPARGC1BQ86YN6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPARGC1BQ86YN6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms