Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CUL4AQ13619 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CUL4AQ13619 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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