Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CALCOCO2Q13137 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALCOCO2Q13137 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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