Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt6.08□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 RPL15BYMR121C 615 nt6.08□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 ICY2YPL250C 411 nt6.08□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 GEX1YCL073C 1848 nt6.08□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 CBP1YJL209W 1965 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 PMA1YGL008C 2757 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YCL075WYCL075W 441 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 DAD1YDR016C 285 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 MRH1YDR033W 963 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 IZH1YDR492W 951 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 HSP12YFL014W 330 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 LOC1YFR001W 615 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YGL015CYGL015C 393 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 SCW4YGR279C 1161 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 LAG1YHL003C 1236 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 RHO4YKR055W 876 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YLR290CYLR290C 834 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 MCK1YNL307C 1128 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 CIN5YOR028C 888 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 GGA1YDR358W 1674 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 VMA13YPR036W 1437 nt6.07□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YIL067CYIL067C 2037 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 RSP5YER125W 2430 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YML020WYML020W 1995 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 PCL5YHR071W 690 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YAP5YIR018W 738 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YKL118WYKL118W 312 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 CGI121YML036W 546 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 THI20YOL055C 1656 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 TBF1YPL128C 1689 nt6.06□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YDR134CYDR134C 411 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 GUK1YDR454C 564 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YDR491CYDR491C 492 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 GET1YGL020C 708 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 RAD33YML011C 534 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 PGA3YML125C 939 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YMR320WYMR320W 306 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 CAT5YOR125C 702 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 SUC2YIL162W 1599 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 PDH1YPR002W 1551 nt6.05□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 ALD2YMR170C 1521 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 IFM1YOL023W 2031 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 TIP20YGL145W 2106 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YER119C-AYER119C-A 372 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 DFG10YIL049W 762 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 FEX1YOR390W 1128 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 snR17asnR17a 333 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 FEX2YPL279C 1128 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 RPN7YPR108W 1290 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 ATE1YGL017W 1512 nt6.04□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 NOG2YNR053C 1461 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 AEP1YMR064W 1557 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YDL071CYDL071C 375 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YDR396WYDR396W 501 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YDR445CYDR445C 408 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YEL057CYEL057C 702 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YER034WYER034W 558 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 TDH3YGR192C 999 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YHR130CYHR130C 336 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 YVH1YIR026C 1095 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 RRT16YNL105W 429 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 MSS18YPR134W 807 nt6.03□□□□□ -1.44
SRF1Q12516 GPI19YDR437W 423 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YER107W-AYER107W-A 321 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YIL060WYIL060W 435 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 GCD14YJL125C 1152 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 HIT1YJR055W 495 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YMR254CYMR254C 309 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YOR053WYOR053W 342 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 EIS1YMR031C 2532 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 UGA2YBR006W 1494 nt6.02□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 VPS17YOR132W 1656 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 HXT5YHR096C 1779 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YCL076WYCL076W 744 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 THO1YER063W 657 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YFL051CYFL051C 483 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 NAT2YGR147C 867 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 PRP45YAL032C 1140 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YJR111CYJR111C 852 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YMR141CYMR141C 309 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YNL205CYNL205C 423 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 MRP21YBL090W 534 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YOL160WYOL160W 342 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 OST2YOR103C 393 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 DCS2YOR173W 1062 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YCL012CYCL012C 405 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 PGM1YKL127W 1713 nt6.01□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 NOT3YIL038C 2511 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 RQC1YDR333C 2172 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 RPS16BYDL083C 432 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YIL029CYIL029C 429 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 YKL131WYKL131W 522 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 ZPS1YOL154W 750 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 RPL19AYBR084C-A 570 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 snR3snR3 194 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 TUL1YKL034W 2277 nt6□□□□□ -1.45
SRF1Q12516 OSH6YKR003W 1347 nt5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.4 ms