Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 UBA2YDR390C 1911 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 SNF3YDL194W 2655 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 BRE2YLR015W 1518 nt5.28□□□□□ -1.56
PUF3Q07807 VID30YGL227W 2877 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 ATG31YDR022C 591 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YDR199WYDR199W 366 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 PEA2YER149C 1263 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 HIS6YIL020C 786 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 GVP36YIL041W 981 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 DAL3YIR032C 588 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 RPS0BYLR048W 759 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 NNT1YLR285W 786 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 CPR3YML078W 549 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 IFM1YOL023W 2031 nt5.27□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 NGL1YOL042W 1092 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 STP22YCL008C 1158 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 TUP1YCR084C 2142 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 FRE3YOR381W 2136 nt5.27□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 SED4YCR067C 3198 nt5.26□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YCL020WYCL020W 1317 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MDM38YOL027C 1722 nt5.26□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 THI22YPR121W 1719 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 UGA3YDL170W 1587 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 AGE1YDR524C 1449 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 VFA1YER128W 612 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YJR087WYJR087W 351 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 RPL40BYKR094C 387 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 JLP1YLL057C 1239 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YLR462WYLR462W 609 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 IMP1YMR150C 573 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YSF3YNL138W-A 258 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YPR202WYPR202W 717 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 GDI1YER136W 1356 nt5.26□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 PDI1YCL043C 1569 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MEC3YLR288C 1425 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 PSE1YMR308C 3270 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 CDC37YDR168W 1521 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 RPL27BYDR471W 411 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 SEC4YFL005W 648 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YFL064CYFL064C 525 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 AML1YGR001C 747 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YHR125WYHR125W 306 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YIL025CYIL025C 375 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 GCD14YJL125C 1152 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 FLD1YLR404W 858 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 RGS2YOR107W 930 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YTA12YMR089C 2478 nt5.25□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 ARP4YJL081C 1470 nt5.25□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MCH4YOL119C 1506 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YDR134CYDR134C 411 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YDR269CYDR269C 324 nt5.24□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPN12YFR052W 825 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 NAT2YGR147C 867 nt5.24□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 CAP2YIL034C 864 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MCM22YJR135C 720 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YMR130WYMR130W 909 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 DDP1YOR163W 567 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YBR062CYBR062C 543 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 APM2YHL019C 1818 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 AVT5YBL089W 1380 nt5.24□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 ELP2YGR200C 2367 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 BOP2YLR267W 1713 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 RCK2YLR248W 1833 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 NSG1YHR133C 876 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MET14YKL001C 609 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 TOM22YNL131W 459 nt5.23□□□□□ -1.57 RIP-Chip
PUF3Q07807 SYC1YOR179C 567 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YOR248WYOR248W 303 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 ROT2YBR229C 2865 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 TIP20YGL145W 2106 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 EKI1YDR147W 1605 nt5.23□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 NDC1YML031W 1968 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 ADE3YGR204W 2841 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 UBC13YDR092W 462 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 THI5YFL058W 1023 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 SDP1YIL113W 630 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YKL177WYKL177W 339 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 CMC2YBL059C-A 330 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 THI12YNL332W 1023 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 YNR021WYNR021W 1215 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 snR10snR10 245 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MET31YPL038W 534 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 UGA1YGR019W 1416 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 OST1YJL002C 1431 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 ZRC1YMR243C 1329 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 ESA1YOR244W 1338 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 MSH1YHR120W 2880 nt5.22□□□□□ -1.57
PUF3Q07807 RSC6YCR052W 1452 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 ACA1YER045C 1470 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 RCM1YNL022C 1473 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 PXA1YPL147W 2613 nt5.21□□□□□ -1.58
PUF3Q07807 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms