Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms