Protein–RNA interactions for Protein: P60412

KRTAP10-11, Keratin-associated protein 10-11, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-11P60412 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP10-11P60412 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP10-11P60412 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms