Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00205P59089 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00205P59089 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478.6 ms