Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRAP19793 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRAP19793 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRAP19793 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRAP19793 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRAP19793 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRAP19793 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRAP19793 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms