Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.97□□□□□ -0.65
RTP1Q12751 YNR029CYNR029C 1290 nt10.97□□□□□ -0.65
RTP1Q12751 FUR4YBR021W 1902 nt10.95□□□□□ -0.66
RTP1Q12751 UTH1YKR042W 1098 nt10.94□□□□□ -0.66
RTP1Q12751 YLR349WYLR349W 507 nt10.94□□□□□ -0.66
RTP1Q12751 TSC10YBR265W 963 nt10.91□□□□□ -0.66
RTP1Q12751 RIB3YDR487C 627 nt10.9□□□□□ -0.66
RTP1Q12751 FUN14YAL008W 597 nt10.89□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 YGR012WYGR012W 1182 nt10.88□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 TIR3YIL011W 810 nt10.88□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 DUT1YBR252W 444 nt10.87□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 ADH7YCR105W 1086 nt10.86□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 CAB5YDR196C 726 nt10.85□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 SHH4YLR164W 507 nt10.85□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 YJL195CYJL195C 702 nt10.84□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 TOM6YOR045W 186 nt10.84□□□□□ -0.67
RTP1Q12751 NBP35YGL091C 987 nt10.83□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 PAU15YIR041W 375 nt10.83□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 AGP1YCL025C 1902 nt10.83□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 HIP1YGR191W 1812 nt10.82□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 PRP4YPR178W 1398 nt10.82□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 NRT1YOR071C 1797 nt10.82□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 PEX2YJL210W 816 nt10.81□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 AAC1YMR056C 930 nt10.81□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 YLR279WYLR279W 390 nt10.79□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 YML089CYML089C 369 nt10.79□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 NAR1YNL240C 1476 nt10.79□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 CCA1YER168C 1641 nt10.78□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 POM34YLR018C 900 nt10.78□□□□□ -0.68
RTP1Q12751 DPS1YLL018C 1674 nt10.77□□□□□ -0.69
RTP1Q12751 MET28YIR017C 564 nt10.75□□□□□ -0.69
RTP1Q12751 ADH1YOL086C 1047 nt10.75□□□□□ -0.69
RTP1Q12751 LSC2YGR244C 1284 nt10.73□□□□□ -0.69
RTP1Q12751 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.72□□□□□ -0.69
RTP1Q12751 YPI1YFR003C 468 nt10.71□□□□□ -0.69
RTP1Q12751 PBP1YGR178C 2169 nt10.7□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 TIF6YPR016C 738 nt10.7□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 BIO5YNR056C 1686 nt10.69□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 PRO1YDR300C 1287 nt10.69□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 YEL008WYEL008W 381 nt10.68□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 GPN2YOR262W 1044 nt10.68□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 SNF1YDR477W 1902 nt10.67□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 FIT3YOR383C 615 nt10.67□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 MSB4YOL112W 1479 nt10.67□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 ATG15YCR068W 1563 nt10.65□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 CPD1YGR247W 720 nt10.65□□□□□ -0.7
RTP1Q12751 ESS1YJR017C 513 nt10.64□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 DUS1YML080W 1272 nt10.64□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 YKR005CYKR005C 1578 nt10.64□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.62□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 CYT2YKL087C 675 nt10.62□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 AQY2YLL052C 450 nt10.62□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 BMT6YLR063W 1098 nt10.62□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 STR3YGL184C 1398 nt10.61□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 GND1YHR183W 1470 nt10.6□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 LOT5YKL183W 921 nt10.59□□□□□ -0.71
RTP1Q12751 ARP6YLR085C 1317 nt10.53□□□□□ -0.72
RTP1Q12751 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.52□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.52□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 IRC24YIR036C 792 nt10.52□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 YCL074WYCL074W 927 nt10.51□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 NAP1YKR048C 1254 nt10.51□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 GAP1YKR039W 1809 nt10.49□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 YGR259CYGR259C 441 nt10.49□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 HSL7YBR133C 2484 nt10.49□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 APT2YDR441C 546 nt10.47□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 SEN2YLR105C 1134 nt10.47□□□□□ -0.73
RTP1Q12751 ALP1YNL270C 1722 nt10.44□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 PUP1YOR157C 786 nt10.44□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 CMP2YML057W 1815 nt10.43□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 SMM1YNR015W 1155 nt10.43□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 BSP1YPR171W 1731 nt10.43□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 YAR028WYAR028W 705 nt10.42□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.41□□□□□ -0.74
RTP1Q12751 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.39□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.39□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 RTN2YDL204W 1182 nt10.38□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 RIB2YOL066C 1776 nt10.37□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 FCY21YER060W 1587 nt10.37□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 ZTA1YBR046C 1005 nt10.37□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 AKR2YOR034C 2250 nt10.37□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 DIF1YLR437C 402 nt10.36□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 PLB1YMR008C 1995 nt10.35□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 MTG2YHR168W 1557 nt10.35□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 PGC1YPL206C 966 nt10.34□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 YAT1YAR035W 2064 nt10.34□□□□□ -0.75
RTP1Q12751 YBR232CYBR232C 360 nt10.33□□□□□ -0.76
RTP1Q12751 HXT12YIL170W 1374 nt10.32□□□□□ -0.76
RTP1Q12751 SSN3YPL042C 1668 nt10.31□□□□□ -0.76
RTP1Q12751 PAU5YFL020C 369 nt10.31□□□□□ -0.76
RTP1Q12751 STP3YLR375W 1032 nt10.3□□□□□ -0.76
RTP1Q12751 VRG4YGL225W 1014 nt10.27□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 PRY1YJL079C 900 nt10.26□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 YJL064WYJL064W 396 nt10.25□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 ALD4YOR374W 1560 nt10.24□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 UTR1YJR049C 1593 nt10.22□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 TIM44YIL022W 1296 nt10.22□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 PAU19YMR325W 375 nt10.22□□□□□ -0.77
RTP1Q12751 CCT5YJR064W 1689 nt10.2□□□□□ -0.78
RTP1Q12751 UGA4YDL210W 1716 nt10.18□□□□□ -0.78
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