Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 MIR1YJR077C 936 nt10.11□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 ALD4YOR374W 1560 nt10.1□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.09□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 YGR201CYGR201C 678 nt10.07□□□□□ -0.8
SEC39Q12745 YNL024CYNL024C 741 nt10.04□□□□□ -0.8
SEC39Q12745 FEN2YCR028C 1539 nt10.03□□□□□ -0.8
SEC39Q12745 VPS60YDR486C 690 nt10.03□□□□□ -0.8
SEC39Q12745 PRM5YIL117C 957 nt10.03□□□□□ -0.8
SEC39Q12745 PAU7YAR020C 168 nt10.02□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 YMR244WYMR244W 1068 nt10.02□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 GLR1YPL091W 1452 nt10□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 YHL008CYHL008C 1884 nt10□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 URA8YJR103W 1737 nt9.99□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 ZRT3YKL175W 1512 nt9.97□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 GID7YCL039W 2238 nt9.97□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 HIS2YFR025C 1008 nt9.97□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 YIR016WYIR016W 798 nt9.97□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 FRE6YLL051C 2139 nt9.97□□□□□ -0.81
SEC39Q12745 DAT1YML113W 747 nt9.96□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 TIM17YJL143W 477 nt9.95□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 ALG3YBL082C 1377 nt9.95□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 PSD1YNL169C 1503 nt9.94□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 ILV3YJR016C 1758 nt9.93□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 UGP1YKL035W 1500 nt9.93□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 YGL034CYGL034C 366 nt9.93□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 PLB1YMR008C 1995 nt9.93□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 GOR1YNL274C 1053 nt9.92□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 YJL067WYJL067W 351 nt9.91□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 AVT6YER119C 1347 nt9.9□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 UBA4YHR111W 1323 nt9.9□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 YOR325WYOR325W 474 nt9.9□□□□□ -0.82
SEC39Q12745 COQ8YGL119W 1506 nt9.89□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 RBG2YGR173W 1107 nt9.88□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 HXK1YFR053C 1458 nt9.87□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 YSR3YKR053C 1215 nt9.87□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 YCR087WYCR087W 516 nt9.84□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 SHB17YKR043C 816 nt9.84□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 CYT1YOR065W 930 nt9.84□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 ALD5YER073W 1563 nt9.84□□□□□ -0.83
SEC39Q12745 YMR226CYMR226C 804 nt9.79□□□□□ -0.84
SEC39Q12745 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.78□□□□□ -0.84
SEC39Q12745 SHM2YLR058C 1410 nt9.77□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 RBG1YAL036C 1110 nt9.77□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 ARP6YLR085C 1317 nt9.76□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 ARO8YGL202W 1503 nt9.76□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 SSN3YPL042C 1668 nt9.75□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 XYL2YLR070C 1071 nt9.75□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 DMA2YNL116W 1569 nt9.75□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 THI72YOR192C 1800 nt9.74□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 KES1YPL145C 1305 nt9.74□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 RET2YFR051C 1641 nt9.74□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 UTR1YJR049C 1593 nt9.73□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 AIM45YPR004C 1035 nt9.73□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 SGA1YIL099W 1650 nt9.72□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 YDR010CYDR010C 333 nt9.72□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 OPI10YOL032W 741 nt9.72□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 SGT2YOR007C 1041 nt9.72□□□□□ -0.85
SEC39Q12745 RSC8YFR037C 1674 nt9.71□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 PHO89YBR296C 1725 nt9.7□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 BET2YPR176C 978 nt9.7□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 SAM35YHR083W 990 nt9.68□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 NIT1YIL164C 600 nt9.67□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 MRP20YDR405W 792 nt9.65□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 SAM1YLR180W 1149 nt9.65□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 CCT2YIL142W 1584 nt9.65□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 GTB1YDR221W 2109 nt9.65□□□□□ -0.86
SEC39Q12745 MEP3YPR138C 1470 nt9.65□□□□□ -0.87
SEC39Q12745 YLR111WYLR111W 333 nt9.63□□□□□ -0.87
SEC39Q12745 YOR072WYOR072W 315 nt9.63□□□□□ -0.87
SEC39Q12745 YHR218WYHR218W 1812 nt9.63□□□□□ -0.87
SEC39Q12745 NBP35YGL091C 987 nt9.6□□□□□ -0.87
SEC39Q12745 PCP1YGR101W 1041 nt9.59□□□□□ -0.87
SEC39Q12745 ZAP1YJL056C 2643 nt9.58□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 CWC15YDR163W 528 nt9.57□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 LSB6YJL100W 1824 nt9.56□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 ODC1YPL134C 933 nt9.55□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 ILV2YMR108W 2064 nt9.55□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 SHY1YGR112W 1170 nt9.54□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 HXT1YHR094C 1713 nt9.53□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 COQ2YNR041C 1119 nt9.53□□□□□ -0.88
SEC39Q12745 RPL4BYDR012W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 RPL4AYBR031W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 MTO1YGL236C 2010 nt9.51□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 GAL2YLR081W 1725 nt9.51□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 CLB6YGR109C 1143 nt9.51□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 MEX67YPL169C 1800 nt9.51□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 YCR102CYCR102C 1107 nt9.5□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 DBP1YPL119C 1854 nt9.5□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 ESBP6YNL125C 2022 nt9.49□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 GAP1YKR039W 1809 nt9.49□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 MDL2YPL270W 2322 nt9.49□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 SDH5YOL071W 489 nt9.49□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 BSP1YPR171W 1731 nt9.48□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 RAD23YEL037C 1197 nt9.47□□□□□ -0.89
SEC39Q12745 SFA1YDL168W 1161 nt9.44□□□□□ -0.9
SEC39Q12745 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.44□□□□□ -0.9
SEC39Q12745 QDR2YIL121W 1629 nt9.44□□□□□ -0.9
SEC39Q12745 HXT10YFL011W 1641 nt9.43□□□□□ -0.9
SEC39Q12745 UTH1YKR042W 1098 nt9.42□□□□□ -0.9
SEC39Q12745 RPS14BYJL191W 417 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.2 ms