Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 UTH1YKR042W 1098 nt15.75■□□□□ 0.11
SMC4Q12267 PAU15YIR041W 375 nt15.74■□□□□ 0.11
SMC4Q12267 TSC10YBR265W 963 nt15.68■□□□□ 0.1
SMC4Q12267 TIR3YIL011W 810 nt15.66■□□□□ 0.1
SMC4Q12267 DUS1YML080W 1272 nt15.66■□□□□ 0.1
SMC4Q12267 AQY2YLL052C 450 nt15.65■□□□□ 0.1
SMC4Q12267 NRT1YOR071C 1797 nt15.64■□□□□ 0.09
SMC4Q12267 HIP1YGR191W 1812 nt15.61■□□□□ 0.09
SMC4Q12267 GPN2YOR262W 1044 nt15.6■□□□□ 0.09
SMC4Q12267 NBP35YGL091C 987 nt15.59■□□□□ 0.09
SMC4Q12267 YJL195CYJL195C 702 nt15.58■□□□□ 0.08
SMC4Q12267 FUN14YAL008W 597 nt15.57■□□□□ 0.08
SMC4Q12267 MSB4YOL112W 1479 nt15.56■□□□□ 0.08
SMC4Q12267 RIB3YDR487C 627 nt15.53■□□□□ 0.08
SMC4Q12267 ATG15YCR068W 1563 nt15.53■□□□□ 0.08
SMC4Q12267 PRO1YDR300C 1287 nt15.51■□□□□ 0.07
SMC4Q12267 POM34YLR018C 900 nt15.5■□□□□ 0.07
SMC4Q12267 SWE1YJL187C 2460 nt15.47■□□□□ 0.07
SMC4Q12267 ADH1YOL086C 1047 nt15.45■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 TIF6YPR016C 738 nt15.45■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt15.43■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 LOT5YKL183W 921 nt15.43■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 AAC1YMR056C 930 nt15.43■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.42■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.42■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 MET28YIR017C 564 nt15.41■□□□□ 0.06
SMC4Q12267 YML089CYML089C 369 nt15.38■□□□□ 0.05
SMC4Q12267 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.38■□□□□ 0.05
SMC4Q12267 STR3YGL184C 1398 nt15.35■□□□□ 0.05
SMC4Q12267 CPD1YGR247W 720 nt15.34■□□□□ 0.05
SMC4Q12267 YPI1YFR003C 468 nt15.33■□□□□ 0.04
SMC4Q12267 YEL008WYEL008W 381 nt15.28■□□□□ 0.04
SMC4Q12267 ZTA1YBR046C 1005 nt15.28■□□□□ 0.04
SMC4Q12267 LSC2YGR244C 1284 nt15.27■□□□□ 0.04
SMC4Q12267 APT2YDR441C 546 nt15.26■□□□□ 0.03
SMC4Q12267 YCL074WYCL074W 927 nt15.25■□□□□ 0.03
SMC4Q12267 ESS1YJR017C 513 nt15.25■□□□□ 0.03
SMC4Q12267 FIT3YOR383C 615 nt15.25■□□□□ 0.03
SMC4Q12267 GND1YHR183W 1470 nt15.24■□□□□ 0.03
SMC4Q12267 AKR2YOR034C 2250 nt15.22■□□□□ 0.03
SMC4Q12267 GAP1YKR039W 1809 nt15.16■□□□□ 0.02
SMC4Q12267 RIB2YOL066C 1776 nt15.14■□□□□ 0.01
SMC4Q12267 LSB3YFR024C-A 1380 nt15.12■□□□□ 0.01
SMC4Q12267 SEN2YLR105C 1134 nt15.11■□□□□ 0.01
SMC4Q12267 SMM1YNR015W 1155 nt15.1■□□□□ 0.01
SMC4Q12267 ARP6YLR085C 1317 nt15.09■□□□□ 0.01
SMC4Q12267 YAR028WYAR028W 705 nt15.07■□□□□ 0
SMC4Q12267 PLB1YMR008C 1995 nt15.06■□□□□ 0
SMC4Q12267 RTN2YDL204W 1182 nt15.06■□□□□ 0
SMC4Q12267 DIF1YLR437C 402 nt15.02■□□□□ -0
SMC4Q12267 PUP1YOR157C 786 nt15.01□□□□□ -0.01
SMC4Q12267 PAU5YFL020C 369 nt15□□□□□ -0.01
SMC4Q12267 PRY1YJL079C 900 nt15□□□□□ -0.01
SMC4Q12267 NAP1YKR048C 1254 nt14.99□□□□□ -0.01
SMC4Q12267 YJL055WYJL055W 738 nt14.98□□□□□ -0.01
SMC4Q12267 ALP1YNL270C 1722 nt14.96□□□□□ -0.01
SMC4Q12267 PGC1YPL206C 966 nt14.95□□□□□ -0.02
SMC4Q12267 MTG2YHR168W 1557 nt14.94□□□□□ -0.02
SMC4Q12267 UGA4YDL210W 1716 nt14.94□□□□□ -0.02
SMC4Q12267 FUR4YBR021W 1902 nt14.92□□□□□ -0.02
SMC4Q12267 UTR1YJR049C 1593 nt14.91□□□□□ -0.02
SMC4Q12267 VRG4YGL225W 1014 nt14.89□□□□□ -0.03
SMC4Q12267 ALD4YOR374W 1560 nt14.88□□□□□ -0.03
SMC4Q12267 FCY21YER060W 1587 nt14.86□□□□□ -0.03
SMC4Q12267 YER190C-AYER190C-A 576 nt14.8□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt14.8□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 YML133W-AYML133W-A 576 nt14.8□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt14.8□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt14.8□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 YJL064WYJL064W 396 nt14.79□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 HXT12YIL170W 1374 nt14.78□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 SED1YDR077W 1017 nt14.78□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 YBR232CYBR232C 360 nt14.78□□□□□ -0.04
SMC4Q12267 PRM5YIL117C 957 nt14.73□□□□□ -0.05
SMC4Q12267 PAU19YMR325W 375 nt14.73□□□□□ -0.05
SMC4Q12267 YGR259CYGR259C 441 nt14.71□□□□□ -0.05
SMC4Q12267 THI72YOR192C 1800 nt14.71□□□□□ -0.05
SMC4Q12267 SLG1YOR008C 1137 nt14.7□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 HSP60YLR259C 1719 nt14.69□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 MEP3YPR138C 1470 nt14.69□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 YKR005CYKR005C 1578 nt14.67□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 YPL251WYPL251W 303 nt14.66□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 CCT5YJR064W 1689 nt14.65□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 SAM35YHR083W 990 nt14.65□□□□□ -0.06
SMC4Q12267 YJR114WYJR114W 393 nt14.64□□□□□ -0.07
SMC4Q12267 STP3YLR375W 1032 nt14.63□□□□□ -0.07
SMC4Q12267 LIP1YMR298W 453 nt14.61□□□□□ -0.07
SMC4Q12267 YJL118WYJL118W 660 nt14.59□□□□□ -0.07
SMC4Q12267 TIP1YBR067C 633 nt14.59□□□□□ -0.07
SMC4Q12267 PAC11YDR488C 1602 nt14.57□□□□□ -0.08
SMC4Q12267 YMR103CYMR103C 363 nt14.57□□□□□ -0.08
SMC4Q12267 TIM44YIL022W 1296 nt14.55□□□□□ -0.08
SMC4Q12267 LSB5YCL034W 1065 nt14.55□□□□□ -0.08
SMC4Q12267 TAF13YML098W 504 nt14.53□□□□□ -0.08
SMC4Q12267 CSM1YCR086W 573 nt14.51□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 GAL3YDR009W 1563 nt14.51□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 TOA2YKL058W 369 nt14.5□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 YMR262WYMR262W 942 nt14.5□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 NUC1YJL208C 990 nt14.49□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 YBL086CYBL086C 1401 nt14.49□□□□□ -0.09
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