Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 HUA1YGR268C 597 nt9.64□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 YSP3YOR003W 1437 nt9.62□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.61□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.61□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 YMR209CYMR209C 1374 nt9.61□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 TIM17YJL143W 477 nt9.6□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 HXK1YFR053C 1458 nt9.59□□□□□ -0.87
NFI1Q12216 HOL1YNR055C 1761 nt9.58□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 NIT1YIL164C 600 nt9.55□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 ALD5YER073W 1563 nt9.54□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 HEM14YER014W 1620 nt9.54□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 MTO1YGL236C 2010 nt9.54□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 RTN2YDL204W 1182 nt9.53□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 YNL115CYNL115C 1935 nt9.52□□□□□ -0.88
NFI1Q12216 MRPL8YJL063C 717 nt9.52□□□□□ -0.89
NFI1Q12216 DAT1YML113W 747 nt9.52□□□□□ -0.89
NFI1Q12216 ADO1YJR105W 1023 nt9.5□□□□□ -0.89
NFI1Q12216 SGT2YOR007C 1041 nt9.5□□□□□ -0.89
NFI1Q12216 PEX25YPL112C 1185 nt9.48□□□□□ -0.89
NFI1Q12216 YCR102CYCR102C 1107 nt9.45□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 YFL066CYFL066C 1179 nt9.45□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 NBP35YGL091C 987 nt9.45□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 PLB1YMR008C 1995 nt9.43□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 FRA1YLL029W 2250 nt9.42□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 ILV3YJR016C 1758 nt9.42□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 VPS75YNL246W 795 nt9.4□□□□□ -0.9
NFI1Q12216 MEP3YPR138C 1470 nt9.39□□□□□ -0.91
NFI1Q12216 ARP6YLR085C 1317 nt9.38□□□□□ -0.91
NFI1Q12216 TPN1YGL186C 1740 nt9.36□□□□□ -0.91
NFI1Q12216 PSD1YNL169C 1503 nt9.36□□□□□ -0.91
NFI1Q12216 YFR018CYFR018C 1092 nt9.34□□□□□ -0.91
NFI1Q12216 PRM5YIL117C 957 nt9.32□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 TOM71YHR117W 1920 nt9.31□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 PRE6YOL038W 765 nt9.31□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 SHH4YLR164W 507 nt9.3□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 MDL2YPL270W 2322 nt9.29□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 TIR3YIL011W 810 nt9.28□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 PAU7YAR020C 168 nt9.28□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 ALR1YOL130W 2580 nt9.28□□□□□ -0.92
NFI1Q12216 HIF1YLL022C 1158 nt9.27□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 UTR1YJR049C 1593 nt9.27□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 ALD4YOR374W 1560 nt9.25□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 LSC2YGR244C 1284 nt9.25□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 GAP1YKR039W 1809 nt9.25□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 PRO1YDR300C 1287 nt9.24□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 UGP1YKL035W 1500 nt9.22□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 SFL1YOR140W 2301 nt9.22□□□□□ -0.93
NFI1Q12216 YDR010CYDR010C 333 nt9.21□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 SHB17YKR043C 816 nt9.21□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 POM34YLR018C 900 nt9.2□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 CYT1YOR065W 930 nt9.2□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 YOR072WYOR072W 315 nt9.2□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 HIS2YFR025C 1008 nt9.19□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 SFA1YDL168W 1161 nt9.18□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 ATG15YCR068W 1563 nt9.17□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.17□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 RBG1YAL036C 1110 nt9.17□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 RSC4YKR008W 1878 nt9.17□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 YDR094WYDR094W 336 nt9.16□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 RRT5YFR032C 870 nt9.16□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 MIR1YJR077C 936 nt9.16□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 YNL024CYNL024C 741 nt9.15□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 NSG2YNL156C 900 nt9.15□□□□□ -0.94
NFI1Q12216 SAM35YHR083W 990 nt9.14□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 TOM6YOR045W 186 nt9.14□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 RET2YFR051C 1641 nt9.13□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 MEX67YPL169C 1800 nt9.12□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 PCP1YGR101W 1041 nt9.12□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 YML089CYML089C 369 nt9.12□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 THI6YPL214C 1623 nt9.12□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 LPD1YFL018C 1500 nt9.11□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.11□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 PAU16YKL224C 372 nt9.1□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 MCM5YLR274W 2328 nt9.1□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 UBA4YHR111W 1323 nt9.09□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 PHO89YBR296C 1725 nt9.09□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 YLR173WYLR173W 1827 nt9.09□□□□□ -0.95
NFI1Q12216 DIF1YLR437C 402 nt9.08□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 DMA2YNL116W 1569 nt9.07□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 THI74YDR438W 1113 nt9.06□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 PEX2YJL210W 816 nt9.06□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 COQ8YGL119W 1506 nt9.05□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 ZRT3YKL175W 1512 nt9.05□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 DUR3YHL016C 2208 nt9.05□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 MAS1YLR163C 1389 nt9.05□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 UFD1YGR048W 1086 nt9.04□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 YSR3YKR053C 1215 nt9.04□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 DBP1YPL119C 1854 nt9.03□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 TIF6YPR016C 738 nt9.03□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 RTG2YGL252C 1767 nt9.03□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 YHR218WYHR218W 1812 nt9.03□□□□□ -0.96
NFI1Q12216 COQ2YNR041C 1119 nt9.02□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 HIP1YGR191W 1812 nt9.02□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 HXT1YHR094C 1713 nt9.01□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 GCD11YER025W 1584 nt8.99□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 YOR325WYOR325W 474 nt8.99□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 LSB5YCL034W 1065 nt8.99□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 RSC8YFR037C 1674 nt8.99□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 YJL067WYJL067W 351 nt8.98□□□□□ -0.97
NFI1Q12216 MRP20YDR405W 792 nt8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms