Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 RIB3YDR487C 627 nt9.04□□□□□ -0.96
MSL5Q12186 GOR1YNL274C 1053 nt9.04□□□□□ -0.96
MSL5Q12186 YJL195CYJL195C 702 nt9.03□□□□□ -0.96
MSL5Q12186 UTH1YKR042W 1098 nt9.03□□□□□ -0.96
MSL5Q12186 RTF1YGL244W 1677 nt9.02□□□□□ -0.97
MSL5Q12186 YLR279WYLR279W 390 nt9.02□□□□□ -0.97
MSL5Q12186 TSC10YBR265W 963 nt9.02□□□□□ -0.97
MSL5Q12186 BSP1YPR171W 1731 nt9.01□□□□□ -0.97
MSL5Q12186 YGR012WYGR012W 1182 nt9□□□□□ -0.97
MSL5Q12186 TIR3YIL011W 810 nt8.96□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 SHH4YLR164W 507 nt8.95□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 PIB2YGL023C 1908 nt8.94□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 ADH1YOL086C 1047 nt8.94□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 TOM6YOR045W 186 nt8.94□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 DUT1YBR252W 444 nt8.94□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 HIP1YGR191W 1812 nt8.94□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 NRT1YOR071C 1797 nt8.92□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 PEX2YJL210W 816 nt8.92□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 ESS1YJR017C 513 nt8.92□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 NBP35YGL091C 987 nt8.91□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 GPN2YOR262W 1044 nt8.91□□□□□ -0.98
MSL5Q12186 ESBP6YNL125C 2022 nt8.9□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 YEL008WYEL008W 381 nt8.89□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 POM34YLR018C 900 nt8.89□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 AGP1YCL025C 1902 nt8.89□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 YPI1YFR003C 468 nt8.88□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 CPD1YGR247W 720 nt8.88□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 YML089CYML089C 369 nt8.88□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 NPP1YCR026C 2229 nt8.88□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 PTK1YKL198C 1989 nt8.87□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.87□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 MET28YIR017C 564 nt8.86□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.86□□□□□ -0.99
MSL5Q12186 MSB4YOL112W 1479 nt8.83□□□□□ -1
MSL5Q12186 TIF6YPR016C 738 nt8.83□□□□□ -1
MSL5Q12186 SFP1YLR403W 2052 nt8.83□□□□□ -1
MSL5Q12186 LSC2YGR244C 1284 nt8.82□□□□□ -1
MSL5Q12186 HSL7YBR133C 2484 nt8.81□□□□□ -1
MSL5Q12186 CCA1YER168C 1641 nt8.8□□□□□ -1
MSL5Q12186 YAT1YAR035W 2064 nt8.79□□□□□ -1
MSL5Q12186 ALG12YNR030W 1656 nt8.79□□□□□ -1
MSL5Q12186 PRO1YDR300C 1287 nt8.79□□□□□ -1
MSL5Q12186 NAP1YKR048C 1254 nt8.79□□□□□ -1
MSL5Q12186 FIT3YOR383C 615 nt8.79□□□□□ -1
MSL5Q12186 GND1YHR183W 1470 nt8.77□□□□□ -1
MSL5Q12186 LOT5YKL183W 921 nt8.77□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 SEN2YLR105C 1134 nt8.77□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 PUP1YOR157C 786 nt8.77□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 YFL054CYFL054C 1941 nt8.76□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 AAC1YMR056C 930 nt8.76□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 MET2YNL277W 1461 nt8.76□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 ATG15YCR068W 1563 nt8.75□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 RFC1YOR217W 2586 nt8.74□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 HEL2YDR266C 1920 nt8.72□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.72□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.72□□□□□ -1.01
MSL5Q12186 DTR1YBR180W 1719 nt8.71□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 YJL225CYJL225C 5277 nt8.71□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 ILV2YMR108W 2064 nt8.69□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 APT2YDR441C 546 nt8.69□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 AQY2YLL052C 450 nt8.69□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 STR3YGL184C 1398 nt8.69□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 DUS1YML080W 1272 nt8.67□□□□□ -1.02
MSL5Q12186 ARP6YLR085C 1317 nt8.64□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 PGC1YPL206C 966 nt8.64□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 SMM1YNR015W 1155 nt8.63□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 YBR232CYBR232C 360 nt8.63□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.62□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.62□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 GAP1YKR039W 1809 nt8.61□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 SWE1YJL187C 2460 nt8.61□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.61□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 PAU5YFL020C 369 nt8.6□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 RIB2YOL066C 1776 nt8.6□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 STP3YLR375W 1032 nt8.59□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.59□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.59□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 ALP1YNL270C 1722 nt8.59□□□□□ -1.03
MSL5Q12186 YJL064WYJL064W 396 nt8.58□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 FCY21YER060W 1587 nt8.57□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 YCL074WYCL074W 927 nt8.57□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 YJR114WYJR114W 393 nt8.57□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 GTB1YDR221W 2109 nt8.56□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 TIM44YIL022W 1296 nt8.56□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 YAR028WYAR028W 705 nt8.56□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 ZTA1YBR046C 1005 nt8.56□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 PAU19YMR325W 375 nt8.55□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 HXT12YIL170W 1374 nt8.55□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 AKR2YOR034C 2250 nt8.54□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 MTG2YHR168W 1557 nt8.52□□□□□ -1.04
MSL5Q12186 HMG2YLR450W 3138 nt8.52□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 HEM14YER014W 1620 nt8.52□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 DIF1YLR437C 402 nt8.52□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 ALD4YOR374W 1560 nt8.52□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 PRY1YJL079C 900 nt8.49□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 SLG1YOR008C 1137 nt8.49□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 TPO4YOR273C 1980 nt8.48□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 RTN2YDL204W 1182 nt8.48□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 VRG4YGL225W 1014 nt8.48□□□□□ -1.05
MSL5Q12186 NAR1YNL240C 1476 nt8.48□□□□□ -1.05
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