Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 SFA1YDL168W 1161 nt9.7□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 SHH4YLR164W 507 nt9.68□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 YGR259CYGR259C 441 nt9.67□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 CYT2YKL087C 675 nt9.67□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 YCR087WYCR087W 516 nt9.66□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 TIR3YIL011W 810 nt9.66□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 IRC24YIR036C 792 nt9.66□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 COQ2YNR041C 1119 nt9.65□□□□□ -0.86
HAL9Q12180 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.64□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 YMR244WYMR244W 1068 nt9.64□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 RBG1YAL036C 1110 nt9.63□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 AIM45YPR004C 1035 nt9.63□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 GLR1YPL091W 1452 nt9.63□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 NDI1YML120C 1542 nt9.62□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 HSL7YBR133C 2484 nt9.61□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 MRP20YDR405W 792 nt9.59□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 POM34YLR018C 900 nt9.59□□□□□ -0.87
HAL9Q12180 ARP6YLR085C 1317 nt9.58□□□□□ -0.88
HAL9Q12180 RTN2YDL204W 1182 nt9.57□□□□□ -0.88
HAL9Q12180 LSC2YGR244C 1284 nt9.57□□□□□ -0.88
HAL9Q12180 TOM6YOR045W 186 nt9.56□□□□□ -0.88
HAL9Q12180 PRO1YDR300C 1287 nt9.55□□□□□ -0.88
HAL9Q12180 PLB1YMR008C 1995 nt9.52□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 YML089CYML089C 369 nt9.52□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 HIP1YGR191W 1812 nt9.5□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 RPL4BYDR012W 1089 nt9.5□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 RPL4AYBR031W 1089 nt9.5□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 CMP2YML057W 1815 nt9.49□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 PEX2YJL210W 816 nt9.49□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 ATG15YCR068W 1563 nt9.48□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.47□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.47□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 GAP1YKR039W 1809 nt9.47□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 RBG2YGR173W 1107 nt9.47□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 RPS14BYJL191W 417 nt9.47□□□□□ -0.89
HAL9Q12180 TIF6YPR016C 738 nt9.46□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 CLB6YGR109C 1143 nt9.45□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 UTH1YKR042W 1098 nt9.43□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 YAT1YAR035W 2064 nt9.43□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 YMR226CYMR226C 804 nt9.42□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 NRT1YOR071C 1797 nt9.4□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 MET28YIR017C 564 nt9.4□□□□□ -0.9
HAL9Q12180 UTR1YJR049C 1593 nt9.39□□□□□ -0.91
HAL9Q12180 BSP1YPR171W 1731 nt9.38□□□□□ -0.91
HAL9Q12180 MET8YBR213W 825 nt9.37□□□□□ -0.91
HAL9Q12180 DIF1YLR437C 402 nt9.36□□□□□ -0.91
HAL9Q12180 YLR111WYLR111W 333 nt9.35□□□□□ -0.91
HAL9Q12180 CSM2YIL132C 642 nt9.34□□□□□ -0.91
HAL9Q12180 SDH5YOL071W 489 nt9.33□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 TSC10YBR265W 963 nt9.33□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 SSN3YPL042C 1668 nt9.32□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 PRM5YIL117C 957 nt9.32□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 YGR012WYGR012W 1182 nt9.3□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 FIT3YOR383C 615 nt9.3□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 YLR279WYLR279W 390 nt9.29□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 HEL2YDR266C 1920 nt9.29□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 CAB5YDR196C 726 nt9.28□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 RAD23YEL037C 1197 nt9.28□□□□□ -0.92
HAL9Q12180 YAR028WYAR028W 705 nt9.27□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 MTG2YHR168W 1557 nt9.25□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 SPT20YOL148C 1815 nt9.25□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 MSB4YOL112W 1479 nt9.24□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 ZTA1YBR046C 1005 nt9.24□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.23□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 SAM35YHR083W 990 nt9.22□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 SAM1YLR180W 1149 nt9.22□□□□□ -0.93
HAL9Q12180 ALP1YNL270C 1722 nt9.21□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 RIB3YDR487C 627 nt9.2□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 HIF1YLL022C 1158 nt9.2□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 RPC82YPR190C 1965 nt9.2□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 AKR2YOR034C 2250 nt9.2□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 ALD4YOR374W 1560 nt9.19□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 INA1YLR413W 2028 nt9.18□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.17□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.17□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.17□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.17□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.17□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 DBP1YPL119C 1854 nt9.15□□□□□ -0.94
HAL9Q12180 SED1YDR077W 1017 nt9.14□□□□□ -0.95
HAL9Q12180 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.13□□□□□ -0.95
HAL9Q12180 LIP1YMR298W 453 nt9.11□□□□□ -0.95
HAL9Q12180 HXT1YHR094C 1713 nt9.09□□□□□ -0.95
HAL9Q12180 YBL086CYBL086C 1401 nt9.09□□□□□ -0.95
HAL9Q12180 Q0010Q0010 387 nt9.08□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 GND1YHR183W 1470 nt9.07□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 FCY21YER060W 1587 nt9.07□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 YJR154WYJR154W 1041 nt9.06□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 YPL251WYPL251W 303 nt9.06□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.05□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 UGA4YDL210W 1716 nt9.05□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 LEU9YOR108W 1815 nt9.04□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 LOT5YKL183W 921 nt9.04□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 RIM8YGL045W 1629 nt9.03□□□□□ -0.96
HAL9Q12180 ZRT3YKL175W 1512 nt9.01□□□□□ -0.97
HAL9Q12180 SMM1YNR015W 1155 nt9.01□□□□□ -0.97
HAL9Q12180 APT2YDR441C 546 nt9□□□□□ -0.97
HAL9Q12180 SHY1YGR112W 1170 nt9□□□□□ -0.97
HAL9Q12180 BRR1YPR057W 1026 nt9□□□□□ -0.97
HAL9Q12180 YPI1YFR003C 468 nt8.99□□□□□ -0.97
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