Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 NRT1YOR071C 1797 nt11.14□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 TIR3YIL011W 810 nt11.14□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 CAB5YDR196C 726 nt11.12□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 TOM6YOR045W 186 nt11.12□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 GPN2YOR262W 1044 nt11.12□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 PTK1YKL198C 1989 nt11.12□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 PEX2YJL210W 816 nt11.11□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.1□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 ADH1YOL086C 1047 nt11.09□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 HIP1YGR191W 1812 nt11.09□□□□□ -0.63
TY3A-GQ12173 YPI1YFR003C 468 nt11.07□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 CPD1YGR247W 720 nt11.07□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 SHH4YLR164W 507 nt11.07□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.07□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 DUT1YBR252W 444 nt11.07□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 YEL008WYEL008W 381 nt11.06□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 ESS1YJR017C 513 nt11.06□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 YML089CYML089C 369 nt11.06□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 NBP35YGL091C 987 nt11.05□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 MET28YIR017C 564 nt11.04□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 POM34YLR018C 900 nt11.03□□□□□ -0.64
TY3A-GQ12173 AGP1YCL025C 1902 nt10.99□□□□□ -0.65
TY3A-GQ12173 FIT3YOR383C 615 nt10.98□□□□□ -0.65
TY3A-GQ12173 NAP1YKR048C 1254 nt10.97□□□□□ -0.65
TY3A-GQ12173 MSB4YOL112W 1479 nt10.96□□□□□ -0.65
TY3A-GQ12173 LSC2YGR244C 1284 nt10.96□□□□□ -0.65
TY3A-GQ12173 TIF6YPR016C 738 nt10.95□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 PRO1YDR300C 1287 nt10.94□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 LOT5YKL183W 921 nt10.94□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 ATG15YCR068W 1563 nt10.93□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 YFL054CYFL054C 1941 nt10.93□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 CCA1YER168C 1641 nt10.92□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 SEN2YLR105C 1134 nt10.92□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 GND1YHR183W 1470 nt10.91□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 AAC1YMR056C 930 nt10.9□□□□□ -0.66
TY3A-GQ12173 YJL225CYJL225C 5277 nt10.89□□□□□ -0.67
TY3A-GQ12173 DUS1YML080W 1272 nt10.89□□□□□ -0.67
TY3A-GQ12173 BOR1YNL275W 1731 nt10.89□□□□□ -0.67
TY3A-GQ12173 AQY2YLL052C 450 nt10.88□□□□□ -0.67
TY3A-GQ12173 PUP1YOR157C 786 nt10.85□□□□□ -0.67
TY3A-GQ12173 APT2YDR441C 546 nt10.8□□□□□ -0.68
TY3A-GQ12173 STR3YGL184C 1398 nt10.79□□□□□ -0.68
TY3A-GQ12173 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.75□□□□□ -0.69
TY3A-GQ12173 SMM1YNR015W 1155 nt10.74□□□□□ -0.69
TY3A-GQ12173 GAP1YKR039W 1809 nt10.72□□□□□ -0.69
TY3A-GQ12173 PAU5YFL020C 369 nt10.72□□□□□ -0.69
TY3A-GQ12173 UME6YDR207C 2511 nt10.71□□□□□ -0.69
TY3A-GQ12173 ALP1YNL270C 1722 nt10.71□□□□□ -0.69
TY3A-GQ12173 ARP6YLR085C 1317 nt10.7□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 RIB2YOL066C 1776 nt10.7□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 YCL074WYCL074W 927 nt10.69□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 PGC1YPL206C 966 nt10.68□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 YBR232CYBR232C 360 nt10.68□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.68□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.68□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 SWE1YJL187C 2460 nt10.67□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 YAR028WYAR028W 705 nt10.67□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 STP3YLR375W 1032 nt10.67□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 TIM44YIL022W 1296 nt10.66□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 YJL064WYJL064W 396 nt10.65□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 AKR2YOR034C 2250 nt10.65□□□□□ -0.7
TY3A-GQ12173 FCY21YER060W 1587 nt10.61□□□□□ -0.71
TY3A-GQ12173 ZTA1YBR046C 1005 nt10.61□□□□□ -0.71
TY3A-GQ12173 YJR114WYJR114W 393 nt10.6□□□□□ -0.71
TY3A-GQ12173 PAU19YMR325W 375 nt10.6□□□□□ -0.71
TY3A-GQ12173 HSP60YLR259C 1719 nt10.59□□□□□ -0.71
TY3A-GQ12173 VRG4YGL225W 1014 nt10.59□□□□□ -0.71
TY3A-GQ12173 HXT12YIL170W 1374 nt10.58□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 RTN2YDL204W 1182 nt10.57□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 DIF1YLR437C 402 nt10.57□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.57□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.57□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 MTG2YHR168W 1557 nt10.56□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 ALD4YOR374W 1560 nt10.56□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 PRY1YJL079C 900 nt10.55□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 SLG1YOR008C 1137 nt10.54□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 RIB1YBL033C 1038 nt10.53□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 PLB1YMR008C 1995 nt10.53□□□□□ -0.72
TY3A-GQ12173 TAF13YML098W 504 nt10.5□□□□□ -0.73
TY3A-GQ12173 MCH5YOR306C 1566 nt10.49□□□□□ -0.73
TY3A-GQ12173 CCT5YJR064W 1689 nt10.49□□□□□ -0.73
TY3A-GQ12173 ALG12YNR030W 1656 nt10.48□□□□□ -0.73
TY3A-GQ12173 YJL055WYJL055W 738 nt10.45□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 SOD2YHR008C 702 nt10.43□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 ERG6YML008C 1152 nt10.43□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 TIP1YBR067C 633 nt10.43□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 THI72YOR192C 1800 nt10.42□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 UGA4YDL210W 1716 nt10.41□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 UTR1YJR049C 1593 nt10.41□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 SAM35YHR083W 990 nt10.41□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 YIA6YIL006W 1122 nt10.41□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 PAR32YDL173W 888 nt10.4□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 SED1YDR077W 1017 nt10.4□□□□□ -0.74
TY3A-GQ12173 LSB5YCL034W 1065 nt10.34□□□□□ -0.75
TY3A-GQ12173 FUR4YBR021W 1902 nt10.34□□□□□ -0.75
TY3A-GQ12173 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TY3A-GQ12173 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TY3A-GQ12173 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TY3A-GQ12173 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
TY3A-GQ12173 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.33□□□□□ -0.76
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