Protein–RNA interactions for Protein: Q12160

YPR063C, Uncharacterized protein YPR063C, yeastyeast

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR063CQ12160 TAD3YLR316C 969 nt8.21□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 RTG1YOL067C 534 nt8.21□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 CCT4YDL143W 1587 nt8.21□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 YOR325WYOR325W 474 nt8.2□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 DUT1YBR252W 444 nt8.2□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 MEP3YPR138C 1470 nt8.19□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 YOR072WYOR072W 315 nt8.19□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 YJL067WYJL067W 351 nt8.17□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 VPS60YDR486C 690 nt8.16□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.16□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 YGR201CYGR201C 678 nt8.16□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 DMA2YNL116W 1569 nt8.16□□□□□ -1.1
YPR063CQ12160 YIR016WYIR016W 798 nt8.14□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 DTR1YBR180W 1719 nt8.13□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.11□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 YLR415CYLR415C 339 nt8.11□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 PLB1YMR008C 1995 nt8.1□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 PCP1YGR101W 1041 nt8.1□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 RSC8YFR037C 1674 nt8.1□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 ARO8YGL202W 1503 nt8.09□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 MTO1YGL236C 2010 nt8.09□□□□□ -1.11
YPR063CQ12160 ALG3YBL082C 1377 nt8.09□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 KES1YPL145C 1305 nt8.08□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 BET2YPR176C 978 nt8.08□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 NRT1YOR071C 1797 nt8.07□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 GOR1YNL274C 1053 nt8.07□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 SGA1YIL099W 1650 nt8.07□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 MEX67YPL169C 1800 nt8.06□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 OPI10YOL032W 741 nt8.04□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 MDL2YPL270W 2322 nt8.04□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 AVT6YER119C 1347 nt8.03□□□□□ -1.12
YPR063CQ12160 YHR218WYHR218W 1812 nt8.02□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 TIM17YJL143W 477 nt8.02□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 TOK1YJL093C 2076 nt8.01□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 BDH1YAL060W 1149 nt8.01□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 RBG1YAL036C 1110 nt8□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 UBX6YJL048C 1191 nt7.98□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 CCT2YIL142W 1584 nt7.97□□□□□ -1.13
YPR063CQ12160 SAM35YHR083W 990 nt7.95□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 ODC1YPL134C 933 nt7.94□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 YSP3YOR003W 1437 nt7.94□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 UTR1YJR049C 1593 nt7.93□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 LSB5YCL034W 1065 nt7.93□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 SHM2YLR058C 1410 nt7.93□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 TPN1YGL186C 1740 nt7.92□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 PEX25YPL112C 1185 nt7.92□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 YNL115CYNL115C 1935 nt7.91□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 ARP6YLR085C 1317 nt7.91□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 CWC15YDR163W 528 nt7.9□□□□□ -1.14
YPR063CQ12160 UFD1YGR048W 1086 nt7.89□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 VPS75YNL246W 795 nt7.88□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 ZAP1YJL056C 2643 nt7.88□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 PAU7YAR020C 168 nt7.87□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 HXT10YFL011W 1641 nt7.86□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 YFR018CYFR018C 1092 nt7.86□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 LSB6YJL100W 1824 nt7.86□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 LPD1YFL018C 1500 nt7.86□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 RFC1YOR217W 2586 nt7.86□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 RRT5YFR032C 870 nt7.85□□□□□ -1.15
YPR063CQ12160 TOM71YHR117W 1920 nt7.84□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 YCR102CYCR102C 1107 nt7.83□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 YDR094WYDR094W 336 nt7.83□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 DAK2YFL053W 1776 nt7.83□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 YFL066CYFL066C 1179 nt7.82□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 DAT1YML113W 747 nt7.82□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 QDR2YIL121W 1629 nt7.81□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 PHO23YNL097C 993 nt7.81□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 SGT2YOR007C 1041 nt7.81□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 NBA1YOL070C 1506 nt7.81□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 HXT1YHR094C 1713 nt7.81□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 BSP1YPR171W 1731 nt7.81□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 MRP20YDR405W 792 nt7.8□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 SHY1YGR112W 1170 nt7.8□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 NIT1YIL164C 600 nt7.79□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 MDM35YKL053C-A 261 nt7.79□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 SBA1YKL117W 651 nt7.79□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 FIT1YDR534C 1587 nt7.79□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 GID8YMR135C 1368 nt7.78□□□□□ -1.16
YPR063CQ12160 MIM1YOL026C 342 nt7.77□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 SSL2YIL143C 2532 nt7.76□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 FRE6YLL051C 2139 nt7.75□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 SHB17YKR043C 816 nt7.75□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 NBP35YGL091C 987 nt7.74□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 LSR1LSR1 1175 nt7.72□□□□□ -1.17
YPR063CQ12160 MRS6YOR370C 1812 nt7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64.6 ms