Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 POM34YLR018C 900 nt10.45□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 PRO1YDR300C 1287 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 RPM1RPM1 483 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 YKR005CYKR005C 1578 nt10.4□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 ARP6YLR085C 1317 nt10.4□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 LSC2YGR244C 1284 nt10.4□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 PEX2YJL210W 816 nt10.4□□□□□ -0.74
VPS54Q12071 RTN2YDL204W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 RPL4BYDR012W 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 RPL4AYBR031W 1089 nt10.38□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 YGR259CYGR259C 441 nt10.37□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 HIP1YGR191W 1812 nt10.37□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 PRP4YPR178W 1398 nt10.37□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 PLB1YMR008C 1995 nt10.36□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 YML089CYML089C 369 nt10.36□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 ATG15YCR068W 1563 nt10.35□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 RPS14BYJL191W 417 nt10.35□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 CLB6YGR109C 1143 nt10.34□□□□□ -0.75
VPS54Q12071 UTH1YKR042W 1098 nt10.32□□□□□ -0.76
VPS54Q12071 TIF6YPR016C 738 nt10.32□□□□□ -0.76
VPS54Q12071 GAP1YKR039W 1809 nt10.32□□□□□ -0.76
VPS54Q12071 DPS1YLL018C 1674 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS54Q12071 RBG2YGR173W 1107 nt10.3□□□□□ -0.76
VPS54Q12071 NRT1YOR071C 1797 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS54Q12071 SDH5YOL071W 489 nt10.26□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 MET28YIR017C 564 nt10.25□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 NAR1YNL240C 1476 nt10.24□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 BMT6YLR063W 1098 nt10.24□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 YMR226CYMR226C 804 nt10.23□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 YLR111WYLR111W 333 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 UTR1YJR049C 1593 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 AAC1YMR056C 930 nt10.21□□□□□ -0.77
VPS54Q12071 TSC10YBR265W 963 nt10.2□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 CAB5YDR196C 726 nt10.18□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 YGR012WYGR012W 1182 nt10.18□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 DIF1YLR437C 402 nt10.18□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 SNF1YDR477W 1902 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 RAD23YEL037C 1197 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 IRC24YIR036C 792 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 YLR279WYLR279W 390 nt10.15□□□□□ -0.78
VPS54Q12071 PRM5YIL117C 957 nt10.14□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 FIT3YOR383C 615 nt10.13□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 MSB4YOL112W 1479 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 YAR028WYAR028W 705 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 ZTA1YBR046C 1005 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 MTG2YHR168W 1557 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS54Q12071 RIB3YDR487C 627 nt10.07□□□□□ -0.8
VPS54Q12071 BIO5YNR056C 1686 nt10.06□□□□□ -0.8
VPS54Q12071 AKR2YOR034C 2250 nt10.05□□□□□ -0.8
VPS54Q12071 ALP1YNL270C 1722 nt10.04□□□□□ -0.8
VPS54Q12071 SAM35YHR083W 990 nt10.03□□□□□ -0.8
VPS54Q12071 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.02□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.02□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.02□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.02□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.02□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.01□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 CMP2YML057W 1815 nt10□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 SAM1YLR180W 1149 nt10□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 ALD4YOR374W 1560 nt9.97□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 CYT2YKL087C 675 nt9.97□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 HIF1YLL022C 1158 nt9.97□□□□□ -0.81
VPS54Q12071 PBP1YGR178C 2169 nt9.96□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 SED1YDR077W 1017 nt9.95□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 DBP1YPL119C 1854 nt9.94□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 FRE6YLL051C 2139 nt9.92□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 LIP1YMR298W 453 nt9.92□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 GND1YHR183W 1470 nt9.91□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 HSL7YBR133C 2484 nt9.91□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 LOT5YKL183W 921 nt9.91□□□□□ -0.82
VPS54Q12071 UGA4YDL210W 1716 nt9.89□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 HXT1YHR094C 1713 nt9.89□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 YBL086CYBL086C 1401 nt9.89□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 SMM1YNR015W 1155 nt9.88□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 YPL251WYPL251W 303 nt9.88□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 FCY21YER060W 1587 nt9.88□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 APT2YDR441C 546 nt9.85□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 ADH1YOL086C 1047 nt9.84□□□□□ -0.83
VPS54Q12071 YPI1YFR003C 468 nt9.83□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 BRR1YPR057W 1026 nt9.82□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 LEU9YOR108W 1815 nt9.82□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 YNR029CYNR029C 1290 nt9.81□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 PRY1YJL079C 900 nt9.8□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 MEP3YPR138C 1470 nt9.79□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 SHY1YGR112W 1170 nt9.79□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 TOA2YKL058W 369 nt9.79□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 YMR103CYMR103C 363 nt9.79□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 YJL195CYJL195C 702 nt9.78□□□□□ -0.84
VPS54Q12071 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.76□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 RAD51YER095W 1203 nt9.76□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 FUN14YAL008W 597 nt9.76□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 RIB2YOL066C 1776 nt9.75□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 GND2YGR256W 1479 nt9.74□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 UFO1YML088W 2007 nt9.73□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.73□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.73□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 STE4YOR212W 1272 nt9.72□□□□□ -0.85
VPS54Q12071 HEL2YDR266C 1920 nt9.71□□□□□ -0.86
VPS54Q12071 ZRT3YKL175W 1512 nt9.71□□□□□ -0.86
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