Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 STR3YGL184C 1398 nt10.19□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 RAD51YER095W 1203 nt10.19□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 AQY2YLL052C 450 nt10.19□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 YGR012WYGR012W 1182 nt10.17□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 TSC10YBR265W 963 nt10.17□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.16□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.16□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 NRT1YOR071C 1797 nt10.16□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 PRO1YDR300C 1287 nt10.15□□□□□ -0.78
YPQ1Q12010 YML089CYML089C 369 nt10.14□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 RIB3YDR487C 627 nt10.12□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 LSC2YGR244C 1284 nt10.12□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 TIF6YPR016C 738 nt10.11□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 YCL074WYCL074W 927 nt10.1□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 MET28YIR017C 564 nt10.1□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 PAC11YDR488C 1602 nt10.1□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 ATG15YCR068W 1563 nt10.09□□□□□ -0.79
YPQ1Q12010 YLR279WYLR279W 390 nt10.08□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 STE4YOR212W 1272 nt10.06□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 NVJ2YPR091C 2313 nt10.06□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 YLR349WYLR349W 507 nt10.04□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 YNR029CYNR029C 1290 nt10.04□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 MSB4YOL112W 1479 nt10.04□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 ARP6YLR085C 1317 nt10.03□□□□□ -0.8
YPQ1Q12010 FUN14YAL008W 597 nt10.02□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 YJL195CYJL195C 702 nt10□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 RPM1RPM1 483 nt10□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 FIT3YOR383C 615 nt9.99□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 GAP1YKR039W 1809 nt9.98□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 ADH1YOL086C 1047 nt9.97□□□□□ -0.81
YPQ1Q12010 ADH7YCR105W 1086 nt9.94□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 PAU15YIR041W 375 nt9.93□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 PLB1YMR008C 1995 nt9.93□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 FUR4YBR021W 1902 nt9.92□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 RTN2YDL204W 1182 nt9.92□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 YPI1YFR003C 468 nt9.92□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 LOT5YKL183W 921 nt9.9□□□□□ -0.82
YPQ1Q12010 GND1YHR183W 1470 nt9.9□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 AAC1YMR056C 930 nt9.87□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 ZTA1YBR046C 1005 nt9.87□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 DIF1YLR437C 402 nt9.86□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 YAR028WYAR028W 705 nt9.85□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 GPN2YOR262W 1044 nt9.85□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 YEL008WYEL008W 381 nt9.84□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 ALP1YNL270C 1722 nt9.84□□□□□ -0.83
YPQ1Q12010 APT2YDR441C 546 nt9.83□□□□□ -0.84
YPQ1Q12010 MTG2YHR168W 1557 nt9.83□□□□□ -0.84
YPQ1Q12010 AKR2YOR034C 2250 nt9.81□□□□□ -0.84
YPQ1Q12010 SMM1YNR015W 1155 nt9.81□□□□□ -0.84
YPQ1Q12010 UTR1YJR049C 1593 nt9.8□□□□□ -0.84
YPQ1Q12010 CPD1YGR247W 720 nt9.78□□□□□ -0.84
YPQ1Q12010 YJL225CYJL225C 5277 nt9.77□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 YGR259CYGR259C 441 nt9.76□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 FCY21YER060W 1587 nt9.75□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 YKR005CYKR005C 1578 nt9.75□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 ESS1YJR017C 513 nt9.74□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 RIB2YOL066C 1776 nt9.73□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.73□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.72□□□□□ -0.85
YPQ1Q12010 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.68□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 PRY1YJL079C 900 nt9.67□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 UGA4YDL210W 1716 nt9.67□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 HXT12YIL170W 1374 nt9.65□□□□□ -0.86
YPQ1Q12010 PRP4YPR178W 1398 nt9.64□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 SED1YDR077W 1017 nt9.64□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 PRM5YIL117C 957 nt9.64□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 SAM35YHR083W 990 nt9.63□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 VRG4YGL225W 1014 nt9.62□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 HSP60YLR259C 1719 nt9.61□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 YJL055WYJL055W 738 nt9.59□□□□□ -0.87
YPQ1Q12010 SEN2YLR105C 1134 nt9.58□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 LIP1YMR298W 453 nt9.58□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 ALD4YOR374W 1560 nt9.58□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 DPS1YLL018C 1674 nt9.58□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 BMT6YLR063W 1098 nt9.56□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 PGC1YPL206C 966 nt9.55□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 YPL251WYPL251W 303 nt9.55□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 PAU5YFL020C 369 nt9.53□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 DBP1YPL119C 1854 nt9.53□□□□□ -0.88
YPQ1Q12010 NAP1YKR048C 1254 nt9.52□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 PUP1YOR157C 786 nt9.52□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 CCT5YJR064W 1689 nt9.51□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 YBL086CYBL086C 1401 nt9.51□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 IRC24YIR036C 792 nt9.51□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 CSM1YCR086W 573 nt9.5□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 YBR232CYBR232C 360 nt9.5□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 MEP3YPR138C 1470 nt9.5□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 YMR103CYMR103C 363 nt9.49□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 BRR1YPR057W 1026 nt9.49□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 LEU9YOR108W 1815 nt9.48□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 HXT1YHR094C 1713 nt9.48□□□□□ -0.89
YPQ1Q12010 STP3YLR375W 1032 nt9.46□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 TOA2YKL058W 369 nt9.45□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 LSB5YCL034W 1065 nt9.44□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 SNF1YDR477W 1902 nt9.43□□□□□ -0.9
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