Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 FHN1YGR131W 525 nt10.71□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 BIO4YNR057C 714 nt10.71□□□□□ -0.69
TFB4Q12004 MPS2YGL075C 1164 nt10.7□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 YHL044WYHL044W 708 nt10.7□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 FAF1YIL019W 1041 nt10.69□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 COX3Q0275 810 nt10.69□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 PRE6YOL038W 765 nt10.69□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 SIM1YIL123W 1431 nt10.67□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 SCO2YBR024W 906 nt10.66□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 GAL1YBR020W 1587 nt10.65□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 SED5YLR026C 1023 nt10.65□□□□□ -0.7
TFB4Q12004 YLR311CYLR311C 348 nt10.64□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 SWP1YMR149W 861 nt10.64□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 PCL10YGL134W 1302 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 GET2YER083C 858 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 RUF21RUF21 707 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 NDJ1YOL104C 1059 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 VPS28YPL065W 729 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 PEX25YPL112C 1185 nt10.63□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 YSP3YOR003W 1437 nt10.62□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 GTT3YEL017W 1014 nt10.62□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 SPC25YER018C 666 nt10.62□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 BDH1YAL060W 1149 nt10.62□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 PTK1YKL198C 1989 nt10.61□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 SUA5YGL169W 1281 nt10.6□□□□□ -0.71
TFB4Q12004 TRM5YHR070W 1500 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 COX16YJL003W 357 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 ERF2YLR246W 1080 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 YLR415CYLR415C 339 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 DIA1YMR316W 1011 nt10.58□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 YDL157CYDL157C 357 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 YFL066CYFL066C 1179 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 SBA1YKL117W 651 nt10.57□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 CCT4YDL143W 1587 nt10.56□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 YFL067WYFL067W 528 nt10.56□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 GPI16YHR188C 1833 nt10.55□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 FAR3YMR052W 615 nt10.54□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 ALG12YNR030W 1656 nt10.53□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 YPR1YDR368W 939 nt10.53□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 TAF4YMR005W 1167 nt10.53□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 DDR2YOL052C-A 186 nt10.53□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 KDX1YKL161C 1302 nt10.53□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 YNL115CYNL115C 1935 nt10.52□□□□□ -0.72
TFB4Q12004 ATF2YGR177C 1608 nt10.52□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 MRI1YPR118W 1236 nt10.52□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 NCP1YHR042W 2076 nt10.52□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 YFL054CYFL054C 1941 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 CRR1YLR213C 1269 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 NEJ1YLR265C 1029 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 TSR2YLR435W 618 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 PEX34YCL056C 435 nt10.51□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.5□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 NAT4YMR069W 858 nt10.49□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 AME1YBR211C 975 nt10.48□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 VPS75YNL246W 795 nt10.47□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 HSL7YBR133C 2484 nt10.47□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 YMR074CYMR074C 438 nt10.46□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 SWC5YBR231C 912 nt10.46□□□□□ -0.73
TFB4Q12004 ANP1YEL036C 1503 nt10.46□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 VPS60YDR486C 690 nt10.45□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 MRS3YJL133W 945 nt10.45□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 YNL040WYNL040W 1371 nt10.44□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 GLK1YCL040W 1503 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 COA2YPL189C-A 207 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 CTR1YPR124W 1221 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 FEN2YCR028C 1539 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 GAT1YFL021W 1533 nt10.43□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 EEB1YPL095C 1371 nt10.41□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 MIR1YJR077C 936 nt10.41□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 TIF34YMR146C 1044 nt10.41□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 YNL165WYNL165W 1221 nt10.41□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 ALG3YBL082C 1377 nt10.4□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 TAZ1YPR140W 1146 nt10.4□□□□□ -0.74
TFB4Q12004 MSF1YPR047W 1410 nt10.4□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 MMS21YEL019C 804 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 SPT8YLR055C 1809 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.39□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 SIR2YDL042C 1689 nt10.38□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 SNG1YGR197C 1644 nt10.37□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 HEM12YDR047W 1089 nt10.37□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 THI74YDR438W 1113 nt10.37□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 YDL158CYDL158C 309 nt10.36□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 YHR054CYHR054C 1065 nt10.36□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 YJL211CYJL211C 444 nt10.36□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 YJR056CYJR056C 711 nt10.36□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 LYS4YDR234W 2082 nt10.36□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 RSA3YLR221C 663 nt10.35□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 YIR016WYIR016W 798 nt10.34□□□□□ -0.75
TFB4Q12004 YGR011WYGR011W 327 nt10.33□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 YER147C-AYER147C-A 411 nt10.32□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 OCA1YNL099C 717 nt10.32□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 RRP1YDR087C 837 nt10.31□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 YMR114CYMR114C 1107 nt10.31□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 SSN3YPL042C 1668 nt10.31□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 LYS12YIL094C 1116 nt10.3□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 MIC10YCL057C-A 294 nt10.3□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 NAS6YGR232W 687 nt10.29□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 YPR150WYPR150W 522 nt10.29□□□□□ -0.76
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