Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 ADH7YCR105W 1086 nt12.24□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 YLR279WYLR279W 390 nt12.24□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 YGR012WYGR012W 1182 nt12.23□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 PAU15YIR041W 375 nt12.23□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 YJL195CYJL195C 702 nt12.23□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 UTH1YKR042W 1098 nt12.23□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 NBP35YGL091C 987 nt12.22□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 TSC10YBR265W 963 nt12.22□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 TOM6YOR045W 186 nt12.21□□□□□ -0.45
CTI6Q08923 HIP1YGR191W 1812 nt12.21□□□□□ -0.46
CTI6Q08923 TIR3YIL011W 810 nt12.2□□□□□ -0.46
CTI6Q08923 ADH1YOL086C 1047 nt12.18□□□□□ -0.46
CTI6Q08923 POM34YLR018C 900 nt12.16□□□□□ -0.46
CTI6Q08923 PEX2YJL210W 816 nt12.15□□□□□ -0.46
CTI6Q08923 NRT1YOR071C 1797 nt12.13□□□□□ -0.47
CTI6Q08923 CCA1YER168C 1641 nt12.1□□□□□ -0.47
CTI6Q08923 ESS1YJR017C 513 nt12.06□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 YML089CYML089C 369 nt12.06□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 TIF6YPR016C 738 nt12.06□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 MSB4YOL112W 1479 nt12.06□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 GPN2YOR262W 1044 nt12.05□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 YEL008WYEL008W 381 nt12.04□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 MET28YIR017C 564 nt12.04□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 BOR1YNL275W 1731 nt12.03□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 HSP60YLR259C 1719 nt12.03□□□□□ -0.48
CTI6Q08923 PRO1YDR300C 1287 nt12.02□□□□□ -0.49
CTI6Q08923 YPI1YFR003C 468 nt12.02□□□□□ -0.49
CTI6Q08923 LSC2YGR244C 1284 nt12.01□□□□□ -0.49
CTI6Q08923 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.01□□□□□ -0.49
CTI6Q08923 CPD1YGR247W 720 nt12□□□□□ -0.49
CTI6Q08923 STR3YGL184C 1398 nt11.95□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.93□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 GND1YHR183W 1470 nt11.93□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 FUR4YBR021W 1902 nt11.93□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 FIT3YOR383C 615 nt11.92□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 UME6YDR207C 2511 nt11.92□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 LOT5YKL183W 921 nt11.91□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 AAC1YMR056C 930 nt11.91□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 PUP1YOR157C 786 nt11.91□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 ATG15YCR068W 1563 nt11.91□□□□□ -0.5
CTI6Q08923 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.88□□□□□ -0.51
CTI6Q08923 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.88□□□□□ -0.51
CTI6Q08923 AQY2YLL052C 450 nt11.85□□□□□ -0.51
CTI6Q08923 SEN2YLR105C 1134 nt11.84□□□□□ -0.51
CTI6Q08923 ARP6YLR085C 1317 nt11.84□□□□□ -0.51
CTI6Q08923 APT2YDR441C 546 nt11.83□□□□□ -0.52
CTI6Q08923 NAP1YKR048C 1254 nt11.81□□□□□ -0.52
CTI6Q08923 DUS1YML080W 1272 nt11.79□□□□□ -0.52
CTI6Q08923 GAP1YKR039W 1809 nt11.77□□□□□ -0.52
CTI6Q08923 SMM1YNR015W 1155 nt11.76□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 PGC1YPL206C 966 nt11.76□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 YBR232CYBR232C 360 nt11.74□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 ALG12YNR030W 1656 nt11.74□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 RIB2YOL066C 1776 nt11.72□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 YCL074WYCL074W 927 nt11.72□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 ZTA1YBR046C 1005 nt11.72□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 FCY21YER060W 1587 nt11.71□□□□□ -0.53
CTI6Q08923 ALP1YNL270C 1722 nt11.69□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 MTG2YHR168W 1557 nt11.68□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 DIF1YLR437C 402 nt11.67□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.67□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 HXT12YIL170W 1374 nt11.67□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 PRP4YPR178W 1398 nt11.67□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 YAR028WYAR028W 705 nt11.65□□□□□ -0.54
CTI6Q08923 PAU5YFL020C 369 nt11.64□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 YJL064WYJL064W 396 nt11.64□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 DPS1YLL018C 1674 nt11.64□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 SNF1YDR477W 1902 nt11.64□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 PLB1YMR008C 1995 nt11.63□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 STP3YLR375W 1032 nt11.62□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 MCH5YOR306C 1566 nt11.62□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 ALD4YOR374W 1560 nt11.62□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 AKR2YOR034C 2250 nt11.61□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 YKR005CYKR005C 1578 nt11.59□□□□□ -0.55
CTI6Q08923 YJR114WYJR114W 393 nt11.57□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 PAU19YMR325W 375 nt11.57□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 BIO5YNR056C 1686 nt11.55□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 RTN2YDL204W 1182 nt11.55□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 PRY1YJL079C 900 nt11.55□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 YJL225CYJL225C 5277 nt11.53□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 CCT5YJR064W 1689 nt11.52□□□□□ -0.56
CTI6Q08923 VRG4YGL225W 1014 nt11.52□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 TIM44YIL022W 1296 nt11.51□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 SLG1YOR008C 1137 nt11.51□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 UTR1YJR049C 1593 nt11.5□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 UGA4YDL210W 1716 nt11.5□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 YJL055WYJL055W 738 nt11.47□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 PBP1YGR178C 2169 nt11.46□□□□□ -0.57
CTI6Q08923 YGR259CYGR259C 441 nt11.45□□□□□ -0.58
CTI6Q08923 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
CTI6Q08923 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
CTI6Q08923 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
CTI6Q08923 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
CTI6Q08923 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.41□□□□□ -0.58
CTI6Q08923 RIB1YBL033C 1038 nt11.38□□□□□ -0.59
CTI6Q08923 NAR1YNL240C 1476 nt11.37□□□□□ -0.59
CTI6Q08923 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.36□□□□□ -0.59
CTI6Q08923 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.36□□□□□ -0.59
CTI6Q08923 CSM1YCR086W 573 nt11.36□□□□□ -0.59
CTI6Q08923 SED1YDR077W 1017 nt11.35□□□□□ -0.59
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