Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 RTN2YDL204W 1182 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM10Q08474 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM10Q08474 LSC2YGR244C 1284 nt7.35□□□□□ -1.23
VAM10Q08474 Q0182Q0182 405 nt7.35□□□□□ -1.23
VAM10Q08474 RBG1YAL036C 1110 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM10Q08474 AIM45YPR004C 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM10Q08474 NDI1YML120C 1542 nt7.33□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 SFA1YDL168W 1161 nt7.33□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 CLB6YGR109C 1143 nt7.33□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 YML089CYML089C 369 nt7.33□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 COQ2YNR041C 1119 nt7.31□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 SBA1YKL117W 651 nt7.3□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 ARP6YLR085C 1317 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 RPL4BYDR012W 1089 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 PRO1YDR300C 1287 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 POM34YLR018C 900 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 SHH4YLR164W 507 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 RPL4AYBR031W 1089 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 GLR1YPL091W 1452 nt7.29□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 TOM6YOR045W 186 nt7.28□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 ATG15YCR068W 1563 nt7.28□□□□□ -1.24
VAM10Q08474 PLB1YMR008C 1995 nt7.26□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 UTH1YKR042W 1098 nt7.26□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 GAP1YKR039W 1809 nt7.26□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 PEX2YJL210W 816 nt7.24□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 HIP1YGR191W 1812 nt7.22□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 MET28YIR017C 564 nt7.22□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 NRT1YOR071C 1797 nt7.22□□□□□ -1.25
VAM10Q08474 SAM35YHR083W 990 nt7.21□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 SDH5YOL071W 489 nt7.21□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 RPS14BYJL191W 417 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 YMR244WYMR244W 1068 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 CMP2YML057W 1815 nt7.19□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 YLR111WYLR111W 333 nt7.18□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 YMR226CYMR226C 804 nt7.18□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 TIF6YPR016C 738 nt7.18□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 FIT3YOR383C 615 nt7.17□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 TSC10YBR265W 963 nt7.17□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 YAT1YAR035W 2064 nt7.16□□□□□ -1.26
VAM10Q08474 UTR1YJR049C 1593 nt7.15□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 ALD4YOR374W 1560 nt7.12□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 HIF1YLL022C 1158 nt7.12□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 RAD23YEL037C 1197 nt7.11□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 PRM5YIL117C 957 nt7.11□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 DIF1YLR437C 402 nt7.11□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 RBG2YGR173W 1107 nt7.1□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 YAR028WYAR028W 705 nt7.1□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 YGR012WYGR012W 1182 nt7.09□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 ALP1YNL270C 1722 nt7.09□□□□□ -1.27
VAM10Q08474 INA1YLR413W 2028 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM10Q08474 SPT20YOL148C 1815 nt7.06□□□□□ -1.28
VAM10Q08474 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.04□□□□□ -1.28
VAM10Q08474 YLR279WYLR279W 390 nt7.03□□□□□ -1.28
VAM10Q08474 AKR2YOR034C 2250 nt7.03□□□□□ -1.28
VAM10Q08474 MTG2YHR168W 1557 nt7.03□□□□□ -1.28
VAM10Q08474 SED1YDR077W 1017 nt7.02□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 RIB3YDR487C 627 nt7.02□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 RPC82YPR190C 1965 nt7.01□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 ZRT3YKL175W 1512 nt7.01□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 LIP1YMR298W 453 nt7□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 HSL7YBR133C 2484 nt7□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 HXT1YHR094C 1713 nt6.99□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 MSB4YOL112W 1479 nt6.98□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 ZTA1YBR046C 1005 nt6.97□□□□□ -1.29
VAM10Q08474 YER190C-AYER190C-A 576 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 YML133W-AYML133W-A 576 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 DBP1YPL119C 1854 nt6.96□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 SAM1YLR180W 1149 nt6.95□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt6.94□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 GND1YHR183W 1470 nt6.93□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 APT2YDR441C 546 nt6.93□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 TOA2YKL058W 369 nt6.91□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 RDN25-1RDN25-1 3396 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 RDN25-2RDN25-2 3396 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 BRR1YPR057W 1026 nt6.9□□□□□ -1.3
VAM10Q08474 YJL067WYJL067W 351 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 LOT5YKL183W 921 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 YBL086CYBL086C 1401 nt6.89□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 LEU9YOR108W 1815 nt6.88□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 YPI1YFR003C 468 nt6.88□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 FCY21YER060W 1587 nt6.87□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 MEP3YPR138C 1470 nt6.87□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 SMM1YNR015W 1155 nt6.87□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 SHY1YGR112W 1170 nt6.86□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 CAB5YDR196C 726 nt6.85□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 SAM2YDR502C 1155 nt6.85□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 YMR103CYMR103C 363 nt6.85□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 YPL251WYPL251W 303 nt6.85□□□□□ -1.31
VAM10Q08474 TRT2tT(CGU)K 72 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 URA6YKL024C 615 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 GND2YGR256W 1479 nt6.83□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 LSB3YFR024C-A 1380 nt6.82□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 UGA4YDL210W 1716 nt6.82□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 PRY1YJL079C 900 nt6.81□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 PET8YNL003C 855 nt6.81□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 ILV3YJR016C 1758 nt6.81□□□□□ -1.32
VAM10Q08474 MUP1YGR055W 1725 nt6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.7 ms