Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 AGP1YCL025C 1902 nt8.42□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 SFP1YLR403W 2052 nt8.41□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 SPT20YOL148C 1815 nt8.4□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 RBG2YGR173W 1107 nt8.39□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 MRP20YDR405W 792 nt8.38□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 Q0182Q0182 405 nt8.38□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 YGR259CYGR259C 441 nt8.36□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 YMR226CYMR226C 804 nt8.36□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 COQ2YNR041C 1119 nt8.36□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 DUT1YBR252W 444 nt8.36□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 MAE1YKL029C 2010 nt8.36□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 SFA1YDL168W 1161 nt8.35□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 DUS1YML080W 1272 nt8.35□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 YGL114WYGL114W 2178 nt8.35□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 RIM8YGL045W 1629 nt8.34□□□□□ -1.07
CSI2Q08054 MET2YNL277W 1461 nt8.32□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 NBP35YGL091C 987 nt8.32□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 TIR3YIL011W 810 nt8.32□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 RPL4BYDR012W 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.31□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 RPL4AYBR031W 1089 nt8.31□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 HMG2YLR450W 3138 nt8.3□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 RPM1RPM1 483 nt8.29□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 RPC82YPR190C 1965 nt8.28□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 NPP1YCR026C 2229 nt8.28□□□□□ -1.08
CSI2Q08054 CLB6YGR109C 1143 nt8.27□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 LSC2YGR244C 1284 nt8.25□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 RPS14BYJL191W 417 nt8.25□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 STR3YGL184C 1398 nt8.24□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 YCL074WYCL074W 927 nt8.24□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 UTH1YKR042W 1098 nt8.24□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 SHH4YLR164W 507 nt8.24□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 YML089CYML089C 369 nt8.24□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 TPO4YOR273C 1980 nt8.23□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 POM34YLR018C 900 nt8.23□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 YLR111WYLR111W 333 nt8.22□□□□□ -1.09
CSI2Q08054 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.2□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.2□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 ACO2YJL200C 2370 nt8.2□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 HIP1YGR191W 1812 nt8.19□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 RAD23YEL037C 1197 nt8.19□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 AQY2YLL052C 450 nt8.19□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 TOM6YOR045W 186 nt8.19□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 MUP1YGR055W 1725 nt8.19□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 SAM1YLR180W 1149 nt8.18□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 ARP6YLR085C 1317 nt8.18□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 INA1YLR413W 2028 nt8.17□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 TSC10YBR265W 963 nt8.17□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 UGA4YDL210W 1716 nt8.17□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 SDH5YOL071W 489 nt8.16□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 PRO1YDR300C 1287 nt8.15□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 MET28YIR017C 564 nt8.15□□□□□ -1.1
CSI2Q08054 NRT1YOR071C 1797 nt8.15□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 PEX2YJL210W 816 nt8.14□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 TIF6YPR016C 738 nt8.14□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 RTN2YDL204W 1182 nt8.13□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 ATG15YCR068W 1563 nt8.12□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 YGR012WYGR012W 1182 nt8.11□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.11□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 FIT3YOR383C 615 nt8.1□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 RIB3YDR487C 627 nt8.09□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 HOL1YNR055C 1761 nt8.09□□□□□ -1.11
CSI2Q08054 YLR279WYLR279W 390 nt8.07□□□□□ -1.12
CSI2Q08054 GAP1YKR039W 1809 nt8.07□□□□□ -1.12
CSI2Q08054 GID7YCL039W 2238 nt8.05□□□□□ -1.12
CSI2Q08054 CAB5YDR196C 726 nt8.03□□□□□ -1.12
CSI2Q08054 URA8YJR103W 1737 nt8.03□□□□□ -1.12
CSI2Q08054 PLB1YMR008C 1995 nt8.02□□□□□ -1.13
CSI2Q08054 MSB4YOL112W 1479 nt8□□□□□ -1.13
CSI2Q08054 YAR028WYAR028W 705 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI2Q08054 DIF1YLR437C 402 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI2Q08054 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.98□□□□□ -1.13
CSI2Q08054 ALP1YNL270C 1722 nt7.95□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 YHL008CYHL008C 1884 nt7.94□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 YPI1YFR003C 468 nt7.93□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 FUN14YAL008W 597 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 HIF1YLL022C 1158 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 GND1YHR183W 1470 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 UTR1YJR049C 1593 nt7.92□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 STE4YOR212W 1272 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 MTG2YHR168W 1557 nt7.91□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 YMR209CYMR209C 1374 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 RAD51YER095W 1203 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 YJL195CYJL195C 702 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 YLR349WYLR349W 507 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 ADH1YOL086C 1047 nt7.9□□□□□ -1.14
CSI2Q08054 AKR2YOR034C 2250 nt7.89□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 GTB1YDR221W 2109 nt7.89□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 SAM35YHR083W 990 nt7.88□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 LOT5YKL183W 921 nt7.88□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 ZTA1YBR046C 1005 nt7.88□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 SSN3YPL042C 1668 nt7.87□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 FCY21YER060W 1587 nt7.86□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 APT2YDR441C 546 nt7.85□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 YNR029CYNR029C 1290 nt7.85□□□□□ -1.15
CSI2Q08054 SED1YDR077W 1017 nt7.83□□□□□ -1.16
CSI2Q08054 UGP1YKL035W 1500 nt7.82□□□□□ -1.16
CSI2Q08054 ALD4YOR374W 1560 nt7.81□□□□□ -1.16
CSI2Q08054 YEL008WYEL008W 381 nt7.81□□□□□ -1.16
CSI2Q08054 THI72YOR192C 1800 nt7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43 ms