Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 RDN18-2RDN18-2 1800 nt7.36□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 YGR259CYGR259C 441 nt7.35□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 AAC1YMR056C 930 nt7.35□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 RPL4BYDR012W 1089 nt7.34□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 YMR226CYMR226C 804 nt7.34□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 RPL4AYBR031W 1089 nt7.34□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 CLB6YGR109C 1143 nt7.31□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 POM34YLR018C 900 nt7.31□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 LSC2YGR244C 1284 nt7.3□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 RPS14BYJL191W 417 nt7.3□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 TOM6YOR045W 186 nt7.3□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 YML089CYML089C 369 nt7.28□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 HIP1YGR191W 1812 nt7.28□□□□□ -1.24
RDS3Q06835 PRO1YDR300C 1287 nt7.27□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 UTH1YKR042W 1098 nt7.27□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 ALG12YNR030W 1656 nt7.27□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 ARP6YLR085C 1317 nt7.27□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 PEX2YJL210W 816 nt7.26□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 RTN2YDL204W 1182 nt7.25□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 YLR111WYLR111W 333 nt7.25□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 IRC24YIR036C 792 nt7.24□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 TIF6YPR016C 738 nt7.24□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 SDH5YOL071W 489 nt7.23□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 NRT1YOR071C 1797 nt7.23□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 ATG15YCR068W 1563 nt7.22□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 RAD23YEL037C 1197 nt7.22□□□□□ -1.25
RDS3Q06835 MET28YIR017C 564 nt7.21□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 TSC10YBR265W 963 nt7.21□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 GAP1YKR039W 1809 nt7.2□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 YGR012WYGR012W 1182 nt7.19□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 SNF1YDR477W 1902 nt7.19□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 SAM1YLR180W 1149 nt7.18□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 PLB1YMR008C 1995 nt7.18□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.17□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 CAB5YDR196C 726 nt7.16□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 RIB3YDR487C 627 nt7.15□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 YLR279WYLR279W 390 nt7.15□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 FIT3YOR383C 615 nt7.15□□□□□ -1.26
RDS3Q06835 BIO5YNR056C 1686 nt7.15□□□□□ -1.27
RDS3Q06835 NAR1YNL240C 1476 nt7.12□□□□□ -1.27
RDS3Q06835 MSB4YOL112W 1479 nt7.11□□□□□ -1.27
RDS3Q06835 DIF1YLR437C 402 nt7.1□□□□□ -1.27
RDS3Q06835 UTR1YJR049C 1593 nt7.08□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 MCH5YOR306C 1566 nt7.08□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 YAR028WYAR028W 705 nt7.07□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.07□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 SAM35YHR083W 990 nt7.06□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 ALP1YNL270C 1722 nt7.06□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 MTG2YHR168W 1557 nt7.05□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 PRM5YIL117C 957 nt7.03□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 ZTA1YBR046C 1005 nt7.03□□□□□ -1.28
RDS3Q06835 UME6YDR207C 2511 nt7.02□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 ALD4YOR374W 1560 nt7.02□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 AKR2YOR034C 2250 nt7.01□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 GND1YHR183W 1470 nt7.01□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 CYT2YKL087C 675 nt7.01□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 YPI1YFR003C 468 nt6.99□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 ADH1YOL086C 1047 nt6.99□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 PBP1YGR178C 2169 nt6.98□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 RAD51YER095W 1203 nt6.98□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 FUN14YAL008W 597 nt6.98□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 LOT5YKL183W 921 nt6.98□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 YJL195CYJL195C 702 nt6.97□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 HIF1YLL022C 1158 nt6.97□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 FCY21YER060W 1587 nt6.96□□□□□ -1.29
RDS3Q06835 YNR029CYNR029C 1290 nt6.96□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 STE4YOR212W 1272 nt6.96□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 YLR349WYLR349W 507 nt6.95□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 SED1YDR077W 1017 nt6.94□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 SMM1YNR015W 1155 nt6.94□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 YER190C-AYER190C-A 576 nt6.93□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt6.93□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 YML133W-AYML133W-A 576 nt6.93□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt6.93□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt6.93□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 APT2YDR441C 546 nt6.92□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 DBP1YPL119C 1854 nt6.92□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 LIP1YMR298W 453 nt6.9□□□□□ -1.3
RDS3Q06835 UGA4YDL210W 1716 nt6.9□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 HXT1YHR094C 1713 nt6.88□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 LSB3YFR024C-A 1380 nt6.88□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 YEL008WYEL008W 381 nt6.88□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 PRY1YJL079C 900 nt6.87□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 ZRT3YKL175W 1512 nt6.86□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 YBL086CYBL086C 1401 nt6.86□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 HXT12YIL170W 1374 nt6.86□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 YPL251WYPL251W 303 nt6.86□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 LEU9YOR108W 1815 nt6.85□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 RIB2YOL066C 1776 nt6.85□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 ADH7YCR105W 1086 nt6.85□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 INA1YLR413W 2028 nt6.84□□□□□ -1.31
RDS3Q06835 YAT1YAR035W 2064 nt6.83□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 CMP2YML057W 1815 nt6.83□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 PAU15YIR041W 375 nt6.83□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 BRR1YPR057W 1026 nt6.83□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 VRG4YGL225W 1014 nt6.81□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 MEP3YPR138C 1470 nt6.8□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 CPD1YGR247W 720 nt6.8□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 GPN2YOR262W 1044 nt6.8□□□□□ -1.32
RDS3Q06835 CSM1YCR086W 573 nt6.79□□□□□ -1.32
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