Protein–RNA interactions for Protein: Q05947

YLR224W, F-box protein YLR224W, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR224WQ05947 YMR209CYMR209C 1374 nt8.66□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 SFP1YLR403W 2052 nt8.65□□□□□ -1.02
YLR224WQ05947 YCR102CYCR102C 1107 nt8.63□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 SAM35YHR083W 990 nt8.63□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 YOR325WYOR325W 474 nt8.63□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.62□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 NIT1YIL164C 600 nt8.61□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 HIS2YFR025C 1008 nt8.59□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 TIM17YJL143W 477 nt8.59□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 BDH1YAL060W 1149 nt8.59□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 UGP1YKL035W 1500 nt8.59□□□□□ -1.03
YLR224WQ05947 COQ8YGL119W 1506 nt8.58□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 GAP1YKR039W 1809 nt8.57□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 YLR415CYLR415C 339 nt8.57□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.56□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 RTG1YOL067C 534 nt8.55□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 ARA2YMR041C 1008 nt8.54□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 RPM1RPM1 483 nt8.53□□□□□ -1.04
YLR224WQ05947 DBP1YPL119C 1854 nt8.52□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 LSC2YGR244C 1284 nt8.52□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 OPI10YOL032W 741 nt8.52□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 SGT2YOR007C 1041 nt8.52□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 TPO4YOR273C 1980 nt8.52□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 HMG2YLR450W 3138 nt8.51□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 UGA4YDL210W 1716 nt8.51□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.51□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 HXT1YHR094C 1713 nt8.51□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 ARO8YGL202W 1503 nt8.5□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 SHY1YGR112W 1170 nt8.5□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 YHL008CYHL008C 1884 nt8.49□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 PSD1YNL169C 1503 nt8.48□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 YSP3YOR003W 1437 nt8.47□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 TIR3YIL011W 810 nt8.47□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 SGA1YIL099W 1650 nt8.46□□□□□ -1.05
YLR224WQ05947 KES1YPL145C 1305 nt8.46□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 CCT2YIL142W 1584 nt8.45□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 PRO1YDR300C 1287 nt8.45□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 YLR122CYLR122C 378 nt8.45□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 NPP1YCR026C 2229 nt8.44□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 SHH4YLR164W 507 nt8.43□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 HUA1YGR268C 597 nt8.42□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 BET2YPR176C 978 nt8.42□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 CWC15YDR163W 528 nt8.41□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 BUR6YER159C 429 nt8.41□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 DIF1YLR437C 402 nt8.41□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 Q0010Q0010 387 nt8.41□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 CYT1YOR065W 930 nt8.4□□□□□ -1.06
YLR224WQ05947 LSB6YJL100W 1824 nt8.4□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 RSC8YFR037C 1674 nt8.4□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 MRP20YDR405W 792 nt8.39□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 DMA2YNL116W 1569 nt8.39□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 ZAP1YJL056C 2643 nt8.38□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 YJR154WYJR154W 1041 nt8.38□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 POM34YLR018C 900 nt8.38□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 ATG15YCR068W 1563 nt8.38□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 YNL115CYNL115C 1935 nt8.38□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 URA6YKL024C 615 nt8.37□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 ABZ2YMR289W 1125 nt8.37□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 YBL086CYBL086C 1401 nt8.37□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 RET2YFR051C 1641 nt8.35□□□□□ -1.07
YLR224WQ05947 LCP5YER127W 1074 nt8.33□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 PEX25YPL112C 1185 nt8.32□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 UFO1YML088W 2007 nt8.31□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 LIP1YMR298W 453 nt8.31□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 URH1YDR400W 1023 nt8.3□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 YML089CYML089C 369 nt8.3□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 ZTA1YBR046C 1005 nt8.3□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 YHR218WYHR218W 1812 nt8.3□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 HXK1YFR053C 1458 nt8.3□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 URA8YJR103W 1737 nt8.29□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 YFL066CYFL066C 1179 nt8.29□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 TOM20YGR082W 552 nt8.29□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 ODC1YPL134C 933 nt8.29□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 ALD5YER073W 1563 nt8.28□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 VPS75YNL246W 795 nt8.28□□□□□ -1.08
YLR224WQ05947 QDR2YIL121W 1629 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 ADO1YJR105W 1023 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.26□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 SED1YDR077W 1017 nt8.25□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 MRPL8YJL063C 717 nt8.25□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 OYE3YPL171C 1203 nt8.25□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 ACH1YBL015W 1581 nt8.25□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 AI5_BETAQ0075 1065 nt8.24□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 PET8YNL003C 855 nt8.24□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 LEU9YOR108W 1815 nt8.24□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 BMT5YIL096C 1011 nt8.23□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 SAM1YLR180W 1149 nt8.22□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 GID8YMR135C 1368 nt8.22□□□□□ -1.09
YLR224WQ05947 SSL2YIL143C 2532 nt8.21□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 SRN2YLR119W 642 nt8.21□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 TOM6YOR045W 186 nt8.21□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 SPP2YOR148C 558 nt8.21□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 FMS1YMR020W 1527 nt8.2□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 YAR028WYAR028W 705 nt8.2□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt8.19□□□□□ -1.1
YLR224WQ05947 YJL118WYJL118W 660 nt8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms