Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 PEX2YJL210W 816 nt12.44□□□□□ -0.42
NSE3Q05541 LSC2YGR244C 1284 nt12.43□□□□□ -0.42
NSE3Q05541 YML089CYML089C 369 nt12.43□□□□□ -0.42
NSE3Q05541 PRO1YDR300C 1287 nt12.42□□□□□ -0.42
NSE3Q05541 HIP1YGR191W 1812 nt12.41□□□□□ -0.42
NSE3Q05541 NRT1YOR071C 1797 nt12.38□□□□□ -0.43
NSE3Q05541 ATG15YCR068W 1563 nt12.37□□□□□ -0.43
NSE3Q05541 RAD23YEL037C 1197 nt12.36□□□□□ -0.43
NSE3Q05541 FUR4YBR021W 1902 nt12.36□□□□□ -0.43
NSE3Q05541 TSC10YBR265W 963 nt12.35□□□□□ -0.43
NSE3Q05541 SAM1YLR180W 1149 nt12.34□□□□□ -0.43
NSE3Q05541 MET28YIR017C 564 nt12.33□□□□□ -0.44
NSE3Q05541 TIF6YPR016C 738 nt12.32□□□□□ -0.44
NSE3Q05541 ARP6YLR085C 1317 nt12.32□□□□□ -0.44
NSE3Q05541 YGR012WYGR012W 1182 nt12.3□□□□□ -0.44
NSE3Q05541 RTN2YDL204W 1182 nt12.28□□□□□ -0.44
NSE3Q05541 GAP1YKR039W 1809 nt12.26□□□□□ -0.45
NSE3Q05541 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.25□□□□□ -0.45
NSE3Q05541 RIB3YDR487C 627 nt12.23□□□□□ -0.45
NSE3Q05541 PLB1YMR008C 1995 nt12.21□□□□□ -0.45
NSE3Q05541 YLR279WYLR279W 390 nt12.21□□□□□ -0.45
NSE3Q05541 FIT3YOR383C 615 nt12.21□□□□□ -0.45
NSE3Q05541 CAB5YDR196C 726 nt12.2□□□□□ -0.46
NSE3Q05541 YGR259CYGR259C 441 nt12.15□□□□□ -0.46
NSE3Q05541 YKR005CYKR005C 1578 nt12.14□□□□□ -0.47
NSE3Q05541 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.14□□□□□ -0.47
NSE3Q05541 MSB4YOL112W 1479 nt12.14□□□□□ -0.47
NSE3Q05541 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.13□□□□□ -0.47
NSE3Q05541 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.13□□□□□ -0.47
NSE3Q05541 PAC11YDR488C 1602 nt12.11□□□□□ -0.47
NSE3Q05541 DIF1YLR437C 402 nt12.08□□□□□ -0.48
NSE3Q05541 YAR028WYAR028W 705 nt12.07□□□□□ -0.48
NSE3Q05541 PRP4YPR178W 1398 nt12.06□□□□□ -0.48
NSE3Q05541 UTR1YJR049C 1593 nt12.06□□□□□ -0.48
NSE3Q05541 HSP60YLR259C 1719 nt12.05□□□□□ -0.48
NSE3Q05541 ALP1YNL270C 1722 nt12.05□□□□□ -0.48
NSE3Q05541 BMT6YLR063W 1098 nt12.01□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 AKR2YOR034C 2250 nt12□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 ZTA1YBR046C 1005 nt12□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 MTG2YHR168W 1557 nt12□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 YJL195CYJL195C 702 nt11.99□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 GND1YHR183W 1470 nt11.98□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 RAD51YER095W 1203 nt11.98□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 YPI1YFR003C 468 nt11.98□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 LOT5YKL183W 921 nt11.98□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 STE4YOR212W 1272 nt11.98□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 DPS1YLL018C 1674 nt11.97□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 FUN14YAL008W 597 nt11.97□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 SAM35YHR083W 990 nt11.96□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 ADH1YOL086C 1047 nt11.96□□□□□ -0.49
NSE3Q05541 YLR349WYLR349W 507 nt11.91□□□□□ -0.5
NSE3Q05541 PRM5YIL117C 957 nt11.9□□□□□ -0.5
NSE3Q05541 AAC1YMR056C 930 nt11.9□□□□□ -0.5
NSE3Q05541 SMM1YNR015W 1155 nt11.89□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 YNR029CYNR029C 1290 nt11.89□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 APT2YDR441C 546 nt11.88□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 IRC24YIR036C 792 nt11.88□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 BOR1YNL275W 1731 nt11.86□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 SED1YDR077W 1017 nt11.85□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 FCY21YER060W 1587 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 ADH7YCR105W 1086 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.84□□□□□ -0.51
NSE3Q05541 PAU15YIR041W 375 nt11.81□□□□□ -0.52
NSE3Q05541 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.8□□□□□ -0.52
NSE3Q05541 LIP1YMR298W 453 nt11.8□□□□□ -0.52
NSE3Q05541 YEL008WYEL008W 381 nt11.79□□□□□ -0.52
NSE3Q05541 GPN2YOR262W 1044 nt11.77□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 RPM1RPM1 483 nt11.76□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 UGA4YDL210W 1716 nt11.76□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 PRY1YJL079C 900 nt11.75□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 RIB2YOL066C 1776 nt11.74□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 ALD4YOR374W 1560 nt11.74□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 SNF1YDR477W 1902 nt11.72□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 DBP1YPL119C 1854 nt11.71□□□□□ -0.53
NSE3Q05541 HXT1YHR094C 1713 nt11.71□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 VRG4YGL225W 1014 nt11.7□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 CPD1YGR247W 720 nt11.7□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 YPL251WYPL251W 303 nt11.69□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 HXT12YIL170W 1374 nt11.68□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 NME1NME1 340 nt11.67□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 YBL086CYBL086C 1401 nt11.67□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 BRR1YPR057W 1026 nt11.66□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 MEP3YPR138C 1470 nt11.65□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 HIF1YLL022C 1158 nt11.65□□□□□ -0.54
NSE3Q05541 TOA2YKL058W 369 nt11.64□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 YMR103CYMR103C 363 nt11.64□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 LEU9YOR108W 1815 nt11.63□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 YJL055WYJL055W 738 nt11.63□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 NVJ2YPR091C 2313 nt11.62□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.59□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 FRE6YLL051C 2139 nt11.59□□□□□ -0.55
NSE3Q05541 ESS1YJR017C 513 nt11.57□□□□□ -0.56
NSE3Q05541 CSM1YCR086W 573 nt11.56□□□□□ -0.56
NSE3Q05541 LSB5YCL034W 1065 nt11.55□□□□□ -0.56
NSE3Q05541 GND2YGR256W 1479 nt11.54□□□□□ -0.56
NSE3Q05541 SHY1YGR112W 1170 nt11.53□□□□□ -0.56
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