Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 ESBP6YNL125C 2022 nt9.67□□□□□ -0.86
RRN11Q04712 PRP4YPR178W 1398 nt9.65□□□□□ -0.86
RRN11Q04712 RBG2YGR173W 1107 nt9.63□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 YMR226CYMR226C 804 nt9.63□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 DUS1YML080W 1272 nt9.62□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 DPS1YLL018C 1674 nt9.59□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 CLB6YGR109C 1143 nt9.59□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 YLR111WYLR111W 333 nt9.59□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 AAC1YMR056C 930 nt9.59□□□□□ -0.87
RRN11Q04712 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.57□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 COQ2YNR041C 1119 nt9.57□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 ILV2YMR108W 2064 nt9.57□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 RPL4BYDR012W 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 BMT6YLR063W 1098 nt9.56□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 RPL4AYBR031W 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 SDH5YOL071W 489 nt9.55□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 AGP1YCL025C 1902 nt9.53□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 YKR005CYKR005C 1578 nt9.53□□□□□ -0.88
RRN11Q04712 DTR1YBR180W 1719 nt9.52□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 YCL074WYCL074W 927 nt9.51□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 SFA1YDL168W 1161 nt9.51□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 TIR3YIL011W 810 nt9.51□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 DUT1YBR252W 444 nt9.51□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 AQY2YLL052C 450 nt9.5□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 UTH1YKR042W 1098 nt9.49□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 TPO4YOR273C 1980 nt9.47□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 HMG2YLR450W 3138 nt9.46□□□□□ -0.89
RRN11Q04712 NBP35YGL091C 987 nt9.46□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 YML089CYML089C 369 nt9.45□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 YGR259CYGR259C 441 nt9.44□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 MAE1YKL029C 2010 nt9.43□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 SNF1YDR477W 1902 nt9.43□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 LSC2YGR244C 1284 nt9.42□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 RAD23YEL037C 1197 nt9.41□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 RPS14BYJL191W 417 nt9.41□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 CYT2YKL087C 675 nt9.41□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 TOM6YOR045W 186 nt9.41□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 UGA4YDL210W 1716 nt9.41□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 BIO5YNR056C 1686 nt9.41□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 IRC24YIR036C 792 nt9.4□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 SAM1YLR180W 1149 nt9.4□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 TSC10YBR265W 963 nt9.4□□□□□ -0.9
RRN11Q04712 STR3YGL184C 1398 nt9.39□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 NRT1YOR071C 1797 nt9.39□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 PEX2YJL210W 816 nt9.38□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 URA8YJR103W 1737 nt9.38□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 GAL2YLR081W 1725 nt9.37□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 GTB1YDR221W 2109 nt9.37□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 POM34YLR018C 900 nt9.37□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 SHH4YLR164W 507 nt9.37□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 ATG15YCR068W 1563 nt9.37□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 PBP1YGR178C 2169 nt9.35□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 MET28YIR017C 564 nt9.35□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 HIP1YGR191W 1812 nt9.34□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 PRO1YDR300C 1287 nt9.34□□□□□ -0.91
RRN11Q04712 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.33□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.33□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 RFC1YOR217W 2586 nt9.33□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 YGR012WYGR012W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 RIM8YGL045W 1629 nt9.31□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 RTN2YDL204W 1182 nt9.31□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 FIT3YOR383C 615 nt9.31□□□□□ -0.92
RRN11Q04712 TIF6YPR016C 738 nt9.27□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 ARP6YLR085C 1317 nt9.27□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 HEM14YER014W 1620 nt9.27□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 RIB3YDR487C 627 nt9.26□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 GAP1YKR039W 1809 nt9.24□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.23□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 TOK1YJL093C 2076 nt9.22□□□□□ -0.93
RRN11Q04712 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.21□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 YLR279WYLR279W 390 nt9.2□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 THI72YOR192C 1800 nt9.19□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 SAM35YHR083W 990 nt9.16□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 PLB1YMR008C 1995 nt9.15□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 ACO2YJL200C 2370 nt9.15□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 YGL114WYGL114W 2178 nt9.15□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 YAR028WYAR028W 705 nt9.15□□□□□ -0.94
RRN11Q04712 YPI1YFR003C 468 nt9.13□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 MSB4YOL112W 1479 nt9.13□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 ALP1YNL270C 1722 nt9.12□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 STE4YOR212W 1272 nt9.12□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 GND1YHR183W 1470 nt9.1□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 AKR2YOR034C 2250 nt9.1□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 YJL195CYJL195C 702 nt9.1□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 LOT5YKL183W 921 nt9.09□□□□□ -0.95
RRN11Q04712 FUN14YAL008W 597 nt9.08□□□□□ -0.96
RRN11Q04712 DIF1YLR437C 402 nt9.08□□□□□ -0.96
RRN11Q04712 CAB5YDR196C 726 nt9.05□□□□□ -0.96
RRN11Q04712 UTR1YJR049C 1593 nt9.04□□□□□ -0.96
RRN11Q04712 ADH7YCR105W 1086 nt9.03□□□□□ -0.96
RRN11Q04712 ADH1YOL086C 1047 nt9.02□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 SPT20YOL148C 1815 nt9.02□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 RSC4YKR008W 1878 nt9□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 MTG2YHR168W 1557 nt9□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 SED1YDR077W 1017 nt9□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 ZTA1YBR046C 1005 nt9□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 YLR349WYLR349W 507 nt8.99□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.99□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 PAU15YIR041W 375 nt8.98□□□□□ -0.97
RRN11Q04712 YNR029CYNR029C 1290 nt8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms