Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 BIO5YNR056C 1686 nt10.37□□□□□ -0.75
SND1Q04007 RBG1YAL036C 1110 nt10.35□□□□□ -0.75
SND1Q04007 AIM45YPR004C 1035 nt10.35□□□□□ -0.75
SND1Q04007 BMT6YLR063W 1098 nt10.34□□□□□ -0.75
SND1Q04007 COQ2YNR041C 1119 nt10.34□□□□□ -0.75
SND1Q04007 RTN2YDL204W 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
SND1Q04007 SHH4YLR164W 507 nt10.33□□□□□ -0.76
SND1Q04007 NDI1YML120C 1542 nt10.33□□□□□ -0.76
SND1Q04007 LSC2YGR244C 1284 nt10.32□□□□□ -0.76
SND1Q04007 ARP6YLR085C 1317 nt10.3□□□□□ -0.76
SND1Q04007 PBP1YGR178C 2169 nt10.29□□□□□ -0.76
SND1Q04007 IRC24YIR036C 792 nt10.28□□□□□ -0.76
SND1Q04007 POM34YLR018C 900 nt10.28□□□□□ -0.76
SND1Q04007 YML089CYML089C 369 nt10.28□□□□□ -0.76
SND1Q04007 PRO1YDR300C 1287 nt10.27□□□□□ -0.77
SND1Q04007 TOM6YOR045W 186 nt10.27□□□□□ -0.77
SND1Q04007 GLR1YPL091W 1452 nt10.25□□□□□ -0.77
SND1Q04007 RPL4BYDR012W 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
SND1Q04007 CLB6YGR109C 1143 nt10.25□□□□□ -0.77
SND1Q04007 NME1NME1 340 nt10.25□□□□□ -0.77
SND1Q04007 RPL4AYBR031W 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
SND1Q04007 ATG15YCR068W 1563 nt10.23□□□□□ -0.77
SND1Q04007 PLB1YMR008C 1995 nt10.23□□□□□ -0.77
SND1Q04007 PEX2YJL210W 816 nt10.21□□□□□ -0.77
SND1Q04007 NAR1YNL240C 1476 nt10.21□□□□□ -0.78
SND1Q04007 BSP1YPR171W 1731 nt10.21□□□□□ -0.78
SND1Q04007 GAP1YKR039W 1809 nt10.2□□□□□ -0.78
SND1Q04007 UTH1YKR042W 1098 nt10.2□□□□□ -0.78
SND1Q04007 SSN3YPL042C 1668 nt10.19□□□□□ -0.78
SND1Q04007 YMR244WYMR244W 1068 nt10.19□□□□□ -0.78
SND1Q04007 HIP1YGR191W 1812 nt10.19□□□□□ -0.78
SND1Q04007 MET28YIR017C 564 nt10.15□□□□□ -0.78
SND1Q04007 RPS14BYJL191W 417 nt10.15□□□□□ -0.78
SND1Q04007 TIF6YPR016C 738 nt10.15□□□□□ -0.78
SND1Q04007 NRT1YOR071C 1797 nt10.15□□□□□ -0.78
SND1Q04007 CYT2YKL087C 675 nt10.13□□□□□ -0.79
SND1Q04007 SDH5YOL071W 489 nt10.11□□□□□ -0.79
SND1Q04007 YMR226CYMR226C 804 nt10.08□□□□□ -0.8
SND1Q04007 UTR1YJR049C 1593 nt10.08□□□□□ -0.8
SND1Q04007 YLR111WYLR111W 333 nt10.06□□□□□ -0.8
SND1Q04007 TSC10YBR265W 963 nt10.06□□□□□ -0.8
SND1Q04007 FIT3YOR383C 615 nt10.05□□□□□ -0.8
SND1Q04007 RBG2YGR173W 1107 nt10.04□□□□□ -0.8
SND1Q04007 SAM35YHR083W 990 nt10.04□□□□□ -0.8
SND1Q04007 DIF1YLR437C 402 nt10.03□□□□□ -0.8
SND1Q04007 Q0010Q0010 387 nt10.03□□□□□ -0.8
SND1Q04007 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.02□□□□□ -0.81
SND1Q04007 PRM5YIL117C 957 nt10.02□□□□□ -0.81
SND1Q04007 RAD23YEL037C 1197 nt10□□□□□ -0.81
SND1Q04007 YGR012WYGR012W 1182 nt10□□□□□ -0.81
SND1Q04007 YAT1YAR035W 2064 nt9.99□□□□□ -0.81
SND1Q04007 YAR028WYAR028W 705 nt9.99□□□□□ -0.81
SND1Q04007 HIF1YLL022C 1158 nt9.96□□□□□ -0.82
SND1Q04007 ALP1YNL270C 1722 nt9.94□□□□□ -0.82
SND1Q04007 ALD4YOR374W 1560 nt9.94□□□□□ -0.82
SND1Q04007 YLR279WYLR279W 390 nt9.94□□□□□ -0.82
SND1Q04007 MTG2YHR168W 1557 nt9.92□□□□□ -0.82
SND1Q04007 AKR2YOR034C 2250 nt9.91□□□□□ -0.82
SND1Q04007 RIB3YDR487C 627 nt9.89□□□□□ -0.83
SND1Q04007 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.89□□□□□ -0.83
SND1Q04007 MSB4YOL112W 1479 nt9.89□□□□□ -0.83
SND1Q04007 ZTA1YBR046C 1005 nt9.88□□□□□ -0.83
SND1Q04007 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.88□□□□□ -0.83
SND1Q04007 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.88□□□□□ -0.83
SND1Q04007 SED1YDR077W 1017 nt9.86□□□□□ -0.83
SND1Q04007 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.85□□□□□ -0.83
SND1Q04007 LIP1YMR298W 453 nt9.84□□□□□ -0.83
SND1Q04007 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
SND1Q04007 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
SND1Q04007 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
SND1Q04007 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
SND1Q04007 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.82□□□□□ -0.84
SND1Q04007 HXT1YHR094C 1713 nt9.82□□□□□ -0.84
SND1Q04007 CAB5YDR196C 726 nt9.81□□□□□ -0.84
SND1Q04007 DBP1YPL119C 1854 nt9.81□□□□□ -0.84
SND1Q04007 HSL7YBR133C 2484 nt9.8□□□□□ -0.84
SND1Q04007 MAS1YLR163C 1389 nt9.8□□□□□ -0.84
SND1Q04007 YJR154WYJR154W 1041 nt9.8□□□□□ -0.84
SND1Q04007 RPC82YPR190C 1965 nt9.77□□□□□ -0.84
SND1Q04007 MCM5YLR274W 2328 nt9.76□□□□□ -0.85
SND1Q04007 SAM1YLR180W 1149 nt9.76□□□□□ -0.85
SND1Q04007 GND1YHR183W 1470 nt9.74□□□□□ -0.85
SND1Q04007 CMP2YML057W 1815 nt9.74□□□□□ -0.85
SND1Q04007 YBL086CYBL086C 1401 nt9.73□□□□□ -0.85
SND1Q04007 LOT5YKL183W 921 nt9.72□□□□□ -0.85
SND1Q04007 FCY21YER060W 1587 nt9.71□□□□□ -0.85
SND1Q04007 APT2YDR441C 546 nt9.71□□□□□ -0.86
SND1Q04007 ZRT3YKL175W 1512 nt9.71□□□□□ -0.86
SND1Q04007 TOA2YKL058W 369 nt9.7□□□□□ -0.86
SND1Q04007 YPL251WYPL251W 303 nt9.7□□□□□ -0.86
SND1Q04007 BRR1YPR057W 1026 nt9.7□□□□□ -0.86
SND1Q04007 LEU9YOR108W 1815 nt9.7□□□□□ -0.86
SND1Q04007 SMM1YNR015W 1155 nt9.69□□□□□ -0.86
SND1Q04007 YPI1YFR003C 468 nt9.68□□□□□ -0.86
SND1Q04007 SHY1YGR112W 1170 nt9.68□□□□□ -0.86
SND1Q04007 MEP3YPR138C 1470 nt9.67□□□□□ -0.86
SND1Q04007 SPT20YOL148C 1815 nt9.67□□□□□ -0.86
SND1Q04007 UGA4YDL210W 1716 nt9.67□□□□□ -0.86
SND1Q04007 RSC4YKR008W 1878 nt9.66□□□□□ -0.86
SND1Q04007 YJL067WYJL067W 351 nt9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms