Protein–RNA interactions for Protein: Q04002

SCC2, Sister chromatid cohesion protein 2, yeastyeast

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Length 1,493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCC2Q04002 UTH1YKR042W 1098 nt16.16■□□□□ 0.18
SCC2Q04002 TOM6YOR045W 186 nt16.16■□□□□ 0.18
SCC2Q04002 TSC10YBR265W 963 nt16.14■□□□□ 0.17
SCC2Q04002 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt16.11■□□□□ 0.17
SCC2Q04002 MSB4YOL112W 1479 nt16.08■□□□□ 0.16
SCC2Q04002 ADH1YOL086C 1047 nt16.06■□□□□ 0.16
SCC2Q04002 NRT1YOR071C 1797 nt16.06■□□□□ 0.16
SCC2Q04002 HIP1YGR191W 1812 nt16.03■□□□□ 0.16
SCC2Q04002 PTK1YKL198C 1989 nt16.03■□□□□ 0.16
SCC2Q04002 RIB3YDR487C 627 nt16.03■□□□□ 0.16
SCC2Q04002 TIR3YIL011W 810 nt16.02■□□□□ 0.15
SCC2Q04002 CCA1YER168C 1641 nt15.99■□□□□ 0.15
SCC2Q04002 ESS1YJR017C 513 nt15.98■□□□□ 0.15
SCC2Q04002 CPD1YGR247W 720 nt15.97■□□□□ 0.15
SCC2Q04002 AAC1YMR056C 930 nt15.97■□□□□ 0.15
SCC2Q04002 LOT5YKL183W 921 nt15.93■□□□□ 0.14
SCC2Q04002 NBP35YGL091C 987 nt15.91■□□□□ 0.14
SCC2Q04002 YFL054CYFL054C 1941 nt15.88■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 YEL008WYEL008W 381 nt15.88■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 AQY2YLL052C 450 nt15.88■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 POM34YLR018C 900 nt15.86■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 ATG15YCR068W 1563 nt15.86■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 TIF6YPR016C 738 nt15.85■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 YPI1YFR003C 468 nt15.84■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 SEN2YLR105C 1134 nt15.84■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 PRO1YDR300C 1287 nt15.84■□□□□ 0.13
SCC2Q04002 PUP1YOR157C 786 nt15.83■□□□□ 0.12
SCC2Q04002 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt15.81■□□□□ 0.12
SCC2Q04002 DUS1YML080W 1272 nt15.8■□□□□ 0.12
SCC2Q04002 MET28YIR017C 564 nt15.77■□□□□ 0.11
SCC2Q04002 APT2YDR441C 546 nt15.75■□□□□ 0.11
SCC2Q04002 ZTA1YBR046C 1005 nt15.72■□□□□ 0.11
SCC2Q04002 GND1YHR183W 1470 nt15.72■□□□□ 0.11
SCC2Q04002 YML089CYML089C 369 nt15.71■□□□□ 0.1
SCC2Q04002 RDN18-1RDN18-1 1800 nt15.7■□□□□ 0.1
SCC2Q04002 RDN18-2RDN18-2 1800 nt15.7■□□□□ 0.1
SCC2Q04002 NAP1YKR048C 1254 nt15.69■□□□□ 0.1
SCC2Q04002 RIB2YOL066C 1776 nt15.65■□□□□ 0.1
SCC2Q04002 PGC1YPL206C 966 nt15.64■□□□□ 0.09
SCC2Q04002 PAU5YFL020C 369 nt15.62■□□□□ 0.09
SCC2Q04002 SWE1YJL187C 2460 nt15.6■□□□□ 0.09
SCC2Q04002 FIT3YOR383C 615 nt15.6■□□□□ 0.09
SCC2Q04002 AKR2YOR034C 2250 nt15.59■□□□□ 0.09
SCC2Q04002 LSB3YFR024C-A 1380 nt15.58■□□□□ 0.08
SCC2Q04002 LSC2YGR244C 1284 nt15.57■□□□□ 0.08
SCC2Q04002 STR3YGL184C 1398 nt15.57■□□□□ 0.08
SCC2Q04002 SMM1YNR015W 1155 nt15.55■□□□□ 0.08
SCC2Q04002 YJR114WYJR114W 393 nt15.52■□□□□ 0.07
SCC2Q04002 YJL064WYJL064W 396 nt15.47■□□□□ 0.07
SCC2Q04002 YBR232CYBR232C 360 nt15.46■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 YJL055WYJL055W 738 nt15.45■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 PRY1YJL079C 900 nt15.45■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 ALD4YOR374W 1560 nt15.44■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 GAP1YKR039W 1809 nt15.44■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 SLG1YOR008C 1137 nt15.43■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 PAU19YMR325W 375 nt15.42■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 YCL074WYCL074W 927 nt15.41■□□□□ 0.06
SCC2Q04002 YAR028WYAR028W 705 nt15.39■□□□□ 0.05
SCC2Q04002 UGA4YDL210W 1716 nt15.37■□□□□ 0.05
SCC2Q04002 ARP6YLR085C 1317 nt15.37■□□□□ 0.05
SCC2Q04002 DIF1YLR437C 402 nt15.37■□□□□ 0.05
SCC2Q04002 PLB1YMR008C 1995 nt15.31■□□□□ 0.04
SCC2Q04002 VRG4YGL225W 1014 nt15.3■□□□□ 0.04
SCC2Q04002 MTG2YHR168W 1557 nt15.3■□□□□ 0.04
SCC2Q04002 FCY21YER060W 1587 nt15.29■□□□□ 0.04
SCC2Q04002 ALP1YNL270C 1722 nt15.28■□□□□ 0.04
SCC2Q04002 HXT12YIL170W 1374 nt15.26■□□□□ 0.03
SCC2Q04002 RTN2YDL204W 1182 nt15.26■□□□□ 0.03
SCC2Q04002 TIP1YBR067C 633 nt15.26■□□□□ 0.03
SCC2Q04002 TIM44YIL022W 1296 nt15.25■□□□□ 0.03
SCC2Q04002 STP3YLR375W 1032 nt15.21■□□□□ 0.03
SCC2Q04002 THI72YOR192C 1800 nt15.21■□□□□ 0.02
SCC2Q04002 UTR1YJR049C 1593 nt15.18■□□□□ 0.02
SCC2Q04002 ERG6YML008C 1152 nt15.16■□□□□ 0.02
SCC2Q04002 CCT5YJR064W 1689 nt15.16■□□□□ 0.02
SCC2Q04002 HSP60YLR259C 1719 nt15.14■□□□□ 0.01
SCC2Q04002 YER190C-AYER190C-A 576 nt15.1■□□□□ 0.01
SCC2Q04002 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt15.1■□□□□ 0.01
SCC2Q04002 YML133W-AYML133W-A 576 nt15.1■□□□□ 0.01
SCC2Q04002 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt15.1■□□□□ 0.01
SCC2Q04002 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt15.1■□□□□ 0.01
SCC2Q04002 SED1YDR077W 1017 nt15.07■□□□□ 0
SCC2Q04002 RIB1YBL033C 1038 nt15.07■□□□□ 0
SCC2Q04002 FUR4YBR021W 1902 nt15.05■□□□□ -0
SCC2Q04002 SOD2YHR008C 702 nt15.02■□□□□ -0
SCC2Q04002 YJL118WYJL118W 660 nt15.01□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 YMR262WYMR262W 942 nt15.01□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 MEP3YPR138C 1470 nt15□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 SNZ1YMR096W 894 nt15□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 YPL251WYPL251W 303 nt15□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 TAF13YML098W 504 nt14.99□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 GAL3YDR009W 1563 nt14.96□□□□□ -0.01
SCC2Q04002 PRM5YIL117C 957 nt14.95□□□□□ -0.02
SCC2Q04002 APS2YJR058C 444 nt14.91□□□□□ -0.02
SCC2Q04002 CSM1YCR086W 573 nt14.9□□□□□ -0.02
SCC2Q04002 LSB5YCL034W 1065 nt14.89□□□□□ -0.03
SCC2Q04002 PAR32YDL173W 888 nt14.88□□□□□ -0.03
SCC2Q04002 TUB4YLR212C 1422 nt14.87□□□□□ -0.03
SCC2Q04002 LIP1YMR298W 453 nt14.86□□□□□ -0.03
SCC2Q04002 YMR103CYMR103C 363 nt14.85□□□□□ -0.03
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