Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 RTN2YDL204W 1182 nt10.71□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 YKR005CYKR005C 1578 nt10.69□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 BOR1YNL275W 1731 nt10.68□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 MRP20YDR405W 792 nt10.68□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 YMR244WYMR244W 1068 nt10.68□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 RBG1YAL036C 1110 nt10.67□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 YML089CYML089C 369 nt10.67□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 NDI1YML120C 1542 nt10.65□□□□□ -0.7
CEF1Q03654 PRP4YPR178W 1398 nt10.65□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 GLR1YPL091W 1452 nt10.64□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 PRO1YDR300C 1287 nt10.64□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 YGR259CYGR259C 441 nt10.63□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 TOM6YOR045W 186 nt10.63□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 HIP1YGR191W 1812 nt10.63□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 RPL4BYDR012W 1089 nt10.62□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 RPL4AYBR031W 1089 nt10.62□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 PLB1YMR008C 1995 nt10.6□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 RPS14BYJL191W 417 nt10.6□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 ESBP6YNL125C 2022 nt10.6□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 TIF6YPR016C 738 nt10.59□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 DPS1YLL018C 1674 nt10.59□□□□□ -0.71
CEF1Q03654 GAP1YKR039W 1809 nt10.56□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 RFC1YOR217W 2586 nt10.56□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 CLB6YGR109C 1143 nt10.55□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 UTH1YKR042W 1098 nt10.55□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 PEX2YJL210W 816 nt10.54□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 NPP1YCR026C 2229 nt10.53□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 ATG15YCR068W 1563 nt10.53□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.53□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.53□□□□□ -0.72
CEF1Q03654 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.52□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 MET28YIR017C 564 nt10.51□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 IRC24YIR036C 792 nt10.5□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 HSL7YBR133C 2484 nt10.5□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 BMT6YLR063W 1098 nt10.49□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 NRT1YOR071C 1797 nt10.48□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 RBG2YGR173W 1107 nt10.47□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 SNF1YDR477W 1902 nt10.46□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 SFP1YLR403W 2052 nt10.46□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 DIF1YLR437C 402 nt10.46□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 YMR226CYMR226C 804 nt10.46□□□□□ -0.73
CEF1Q03654 UTR1YJR049C 1593 nt10.46□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 AAC1YMR056C 930 nt10.45□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 TSC10YBR265W 963 nt10.43□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 YAT1YAR035W 2064 nt10.43□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 FIT3YOR383C 615 nt10.42□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 RAD23YEL037C 1197 nt10.41□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 ALG12YNR030W 1656 nt10.4□□□□□ -0.74
CEF1Q03654 YLR279WYLR279W 390 nt10.39□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 MAS1YLR163C 1389 nt10.38□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 ILV2YMR108W 2064 nt10.37□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 CAB5YDR196C 726 nt10.37□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 YGR012WYGR012W 1182 nt10.37□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 YAR028WYAR028W 705 nt10.36□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.36□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 PRM5YIL117C 957 nt10.35□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 MTG2YHR168W 1557 nt10.35□□□□□ -0.75
CEF1Q03654 YLR111WYLR111W 333 nt10.33□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 DTR1YBR180W 1719 nt10.33□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 SDH5YOL071W 489 nt10.32□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 MET2YNL277W 1461 nt10.31□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 MSB4YOL112W 1479 nt10.31□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 RIB3YDR487C 627 nt10.31□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 BIO5YNR056C 1686 nt10.3□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 ALP1YNL270C 1722 nt10.3□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 HEL2YDR266C 1920 nt10.29□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 ZTA1YBR046C 1005 nt10.29□□□□□ -0.76
CEF1Q03654 SAM35YHR083W 990 nt10.27□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 DBP1YPL119C 1854 nt10.25□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 ALD4YOR374W 1560 nt10.24□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 HIF1YLL022C 1158 nt10.23□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 AKR2YOR034C 2250 nt10.23□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 MCM5YLR274W 2328 nt10.23□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 GTB1YDR221W 2109 nt10.21□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 SED1YDR077W 1017 nt10.21□□□□□ -0.77
CEF1Q03654 SAM1YLR180W 1149 nt10.19□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 HMG2YLR450W 3138 nt10.19□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 FCY21YER060W 1587 nt10.18□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.18□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 PBP1YGR178C 2169 nt10.17□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.17□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.17□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.17□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.17□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.17□□□□□ -0.78
CEF1Q03654 YBL086CYBL086C 1401 nt10.15□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 LIP1YMR298W 453 nt10.14□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 HEM14YER014W 1620 nt10.14□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 GND1YHR183W 1470 nt10.13□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 LEU9YOR108W 1815 nt10.13□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 APT2YDR441C 546 nt10.13□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 HXT1YHR094C 1713 nt10.12□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 YPL251WYPL251W 303 nt10.11□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 Q0010Q0010 387 nt10.09□□□□□ -0.79
CEF1Q03654 UGA4YDL210W 1716 nt10.08□□□□□ -0.8
CEF1Q03654 TOK1YJL093C 2076 nt10.06□□□□□ -0.8
CEF1Q03654 LOT5YKL183W 921 nt10.06□□□□□ -0.8
CEF1Q03654 TPO4YOR273C 1980 nt10.06□□□□□ -0.8
CEF1Q03654 YPI1YFR003C 468 nt10.05□□□□□ -0.8
CEF1Q03654 UFO1YML088W 2007 nt10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms