Protein–RNA interactions for Protein: Q01477

UBP3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP3Q01477 Q0010Q0010 387 nt10.75□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 RTN2YDL204W 1182 nt10.74□□□□□ -0.69 RIP-Chip
UBP3Q01477 POM34YLR018C 900 nt10.74□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 PLB1YMR008C 1995 nt10.74□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 PRO1YDR300C 1287 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 SBA1YKL117W 651 nt10.73□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 TOM6YOR045W 186 nt10.72□□□□□ -0.69 RIP-Chip
UBP3Q01477 SNF1YDR477W 1902 nt10.71□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 LSC2YGR244C 1284 nt10.69□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 BMT6YLR063W 1098 nt10.69□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 BSP1YPR171W 1731 nt10.68□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 AAC1YMR056C 930 nt10.68□□□□□ -0.7 RIP-Chip
UBP3Q01477 RBG1YAL036C 1110 nt10.66□□□□□ -0.7 RIP-Chip
UBP3Q01477 YCR087WYCR087W 516 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 MRP20YDR405W 792 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 IRC24YIR036C 792 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 AIM45YPR004C 1035 nt10.65□□□□□ -0.7
UBP3Q01477 GAP1YKR039W 1809 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.63□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 PEX2YJL210W 816 nt10.63□□□□□ -0.71 RIP-Chip
UBP3Q01477 ATG15YCR068W 1563 nt10.61□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 YML089CYML089C 369 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 HIP1YGR191W 1812 nt10.6□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 NDI1YML120C 1542 nt10.59□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 UTR1YJR049C 1593 nt10.59□□□□□ -0.71
UBP3Q01477 BIO5YNR056C 1686 nt10.58□□□□□ -0.72
UBP3Q01477 YJR154WYJR154W 1041 nt10.58□□□□□ -0.72
UBP3Q01477 TIF6YPR016C 738 nt10.58□□□□□ -0.72
UBP3Q01477 RPL4BYDR012W 1089 nt10.54□□□□□ -0.72
UBP3Q01477 PRM5YIL117C 957 nt10.54□□□□□ -0.72
UBP3Q01477 RPL4AYBR031W 1089 nt10.54□□□□□ -0.72 RIP-Chip
UBP3Q01477 MET8YBR213W 825 nt10.53□□□□□ -0.72
UBP3Q01477 RPS14BYJL191W 417 nt10.52□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 NAR1YNL240C 1476 nt10.5□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 DIF1YLR437C 402 nt10.49□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 SSN3YPL042C 1668 nt10.48□□□□□ -0.73 RIP-Chip
UBP3Q01477 NRT1YOR071C 1797 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 CLB6YGR109C 1143 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 MET28YIR017C 564 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 UTH1YKR042W 1098 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 YMR244WYMR244W 1068 nt10.48□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 GLR1YPL091W 1452 nt10.47□□□□□ -0.73
UBP3Q01477 HIF1YLL022C 1158 nt10.41□□□□□ -0.74
UBP3Q01477 ALD4YOR374W 1560 nt10.39□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 PBP1YGR178C 2169 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 MTG2YHR168W 1557 nt10.38□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 MAS1YLR163C 1389 nt10.37□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 CMP2YML057W 1815 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 ZTA1YBR046C 1005 nt10.36□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YAR028WYAR028W 705 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 CAB5YDR196C 726 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 YLR279WYLR279W 390 nt10.34□□□□□ -0.75
UBP3Q01477 SDH5YOL071W 489 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 TSC10YBR265W 963 nt10.33□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 YGR012WYGR012W 1182 nt10.32□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 SAM35YHR083W 990 nt10.32□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 FIT3YOR383C 615 nt10.32□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 HSL7YBR133C 2484 nt10.32□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 DBP1YPL119C 1854 nt10.31□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 MSB4YOL112W 1479 nt10.3□□□□□ -0.76 RIP-Chip
UBP3Q01477 AKR2YOR034C 2250 nt10.29□□□□□ -0.76
UBP3Q01477 ALP1YNL270C 1722 nt10.28□□□□□ -0.76 RIP-Chip
UBP3Q01477 RBG2YGR173W 1107 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 CYT2YKL087C 675 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 HEL2YDR266C 1920 nt10.26□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 RAD23YEL037C 1197 nt10.25□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 RSC4YKR008W 1878 nt10.24□□□□□ -0.77 RIP-Chip
UBP3Q01477 YMR226CYMR226C 804 nt10.24□□□□□ -0.77 RIP-Chip
UBP3Q01477 SED1YDR077W 1017 nt10.23□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 YLR111WYLR111W 333 nt10.23□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.23□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 LIP1YMR298W 453 nt10.23□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 HXT1YHR094C 1713 nt10.23□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 YBL086CYBL086C 1401 nt10.22□□□□□ -0.77
UBP3Q01477 MCM5YLR274W 2328 nt10.21□□□□□ -0.78
UBP3Q01477 RIB3YDR487C 627 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP3Q01477 YPL251WYPL251W 303 nt10.19□□□□□ -0.78
UBP3Q01477 SHY1YGR112W 1170 nt10.17□□□□□ -0.78
UBP3Q01477 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.16□□□□□ -0.78
UBP3Q01477 LEU9YOR108W 1815 nt10.15□□□□□ -0.78
UBP3Q01477 UGA4YDL210W 1716 nt10.14□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 BRR1YPR057W 1026 nt10.13□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 MET2YNL277W 1461 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 ZRT3YKL175W 1512 nt10.12□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 YAT1YAR035W 2064 nt10.11□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 FCY21YER060W 1587 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 YMR103CYMR103C 363 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 UFO1YML088W 2007 nt10.1□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 YDR306CYDR306C 1437 nt10.09□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 CSM2YIL132C 642 nt10.09□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 TOA2YKL058W 369 nt10.09□□□□□ -0.79
UBP3Q01477 YJL067WYJL067W 351 nt10.08□□□□□ -0.8
UBP3Q01477 SAM1YLR180W 1149 nt10.08□□□□□ -0.8
UBP3Q01477 PAB1YER165W 1734 nt10.07□□□□□ -0.8
UBP3Q01477 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.07□□□□□ -0.8
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